溶液（水或者其它溶液）應該使用0.1%的DEPC處理。DEPC是一種強大但非絕對的RNase抑制劑。濃度為0.1%的DEPC經常用于處理玻璃或者塑料耗材，以使其表面的RNase失活，或者制備不含RNase的的溶液和水。DEPC通過共價修飾使RNase失活。在100 ml要處理的溶液中加入0.1 ml DEPC，大力的搖晃，以使DEPC充分進入溶液。將溶液在37°C的條件下孵育12個小時。在高壓滅菌器內處理15 min以去除任何DEPC的痕跡。DEPC與伯胺發生反應，因此不能直接用于處理Tris緩沖液。在Tris緩沖液存在的條件下，DEPC非常不穩定，迅速分解為乙醇和CO2。在制備Tris緩沖液時，應先使用DEPC處理水，然后將Tris溶解以制備合適的緩沖液。痕量的DEPC會通過乙酰基化作用，與RNA分子中的嘌呤殘基反應，將其修飾。在細胞外的環境中，乙酰基化的RNA分子以很低的效率被翻譯。但是，除非有大量的嘌呤殘基被修飾了，否則不會嚴重的影響這些RNA分子雜交形成DNA：RNA或者RNA：RNA雜交物的能力。溶液或者器皿上殘留的DEPC，一定要在高壓滅菌器中處理或者加熱到100°C處理15 min，以便除去。
重要：在使用化學試劑時，一定要穿戴合適的實驗工作服，一次性的手套以及護目鏡。請參考產品廠商提供的相應安全數據說明書（SDS），了解更多信息。
| 生物樣本中RNA的穩定處理 |
為了確保基因表達分析的精確性，所分析的RNA應能夠準確地反映出其在生物樣本中的體內表達情況。但實際在樣本的操作和RNA的分離過程中，RNA很容易發生改變而使情況變得復雜。 生物樣本一經提取，其中的RNA即變得極不穩定。期間所發生的人為影響主要分成兩種。基因的下調和RNA的酶促降解會導致mRNA特異性或非特異地發生人為降低。同時在操作和加工樣本的過程中，某些基因會被誘導表達。這兩種效應的綜合可能在檢出的轉錄譜與體內真實情況之間造成偏差。 對RNA表達譜進行即刻的穩定化處理是精確基因表達分析中的首要事項。通常情況下，用于RNA分析的樣本被迅速置于液氮中冷凍，在進一步處理之前一直儲存于–80°C下。產品供應商也提供了一些穩定處理試劑，作為替代方法對生物樣本中的RNA進行穩定化處理。這些供應商提供了集成化的樣本處理溶液（套裝），其中包括容器，穩定處理試劑及制備試劑盒 來自參考文獻2。換算為核酸：RNA RNA分子量和摩爾換算 * mRNA平均長度為1930個核苷酸。 |