試劑準備
1、 TROzlo試劑、氯仿、75%乙醇(0.1% DEPC配制)。
2、 塑料器皿需用0.1% DEPC水浸泡。
3、 0.1%DEPC水:100ml dd水中加入DEPC0.1ml,充分振蕩,37℃孵育12h以上,121℃高壓滅菌20min,于4℃保存。
操作步驟
1、 樣品處理
(1) 組織:50-100mg組織中加入1ml TROzlo試劑。
(2) 單層細胞:加入TROzlo試劑1ml/cm2平板。
(3) 懸浮細胞:處理前洗滌細胞,以防止RNA降解。每5-10×105動物、植物或酵母細胞,或1×107細菌加入1 ml TROzlo試劑。
2、 將上述樣品于15-30℃靜置5min,使核蛋白充分解離。
3、 加入0.2ml(1 ml TROzlo試劑)氯仿,蓋緊蓋子,充分劇烈振蕩15s并于15-30℃靜置2-3min。
4、 于2-8℃ 12000g離心15min。離心后樣品分層,上層水相中含RNA,下層有機相中含蛋白和DNA。
5、 取上清,加入0.5ml異丙醇,輕輕混勻,于15-30℃靜置10min后,在管底會出現膠狀沉淀,即為RNA。
6、 于2-8℃ 12000g離心10min后棄去上清。
7、 向沉淀中加入1ml 75%乙醇,輕輕混勻。
8、 于2-8℃ 7500g離心5min后棄上清
9、 將RNA樣品涼干(不要徹底干燥),加入適量DEPC水溶解(可于55-60℃促溶10min)。
注意問題
1、 在加入氯仿之前(第1步),樣品能于-60- -70℃保存至少一個月。
2、 RNA沉淀(第6步)在75%乙醇中于2-8℃能保存至少一周,于-5- -20℃能保存至少一年。
四、 RNA定量
RNA(mg/mL)=40×OD260×稀釋倍數(n)/1000
RNA純品OD260/OD280=2.0
RNA電泳
(1)用1×TAE電泳緩沖液制作瓊脂糖凝膠,加1×TAE電泳緩沖液至液面覆蓋凝膠。
(2)在超凈工作臺上,用移液器吸取總RNA樣品4μl于封口膜上。在實驗臺上再加入5μl 1×TAE電泳緩沖液及1μl 的10×載樣緩沖液,混勻后,小心加入點樣孔。
(3)打開電源開關,調節電壓至100V,使RNA由負極向正極電泳,約30min后將凝膠放入EB染液中染色5min,用清水稍微漂洗。在紫外透射檢測儀上觀察RNA電泳結果。