TRIzol影響實驗結果？miRNA文章被撤回

發布時間：2012-07-16 00:00 原文鏈接： TRIzol影響實驗結果？miRNA文章被撤回

　　韓國首爾大學的科學家Narry Kim(金娜蕊)及其研究小組近日撤回了一篇關于microRNA(miRNA)衰減的文章，因為她們發現，所用的TRIzol試劑會對富含GC的miRNA或具二級結構的miRNA產生不同影響。

　　這篇文章去年發表于《Molecular Cell》雜志上。研究人員發現，一旦細胞粘附性喪失，某些miRNA迅速降解。當他們以低密度培養細胞或用胰酶或EGTA解離細胞時，細胞內成熟 miR-141表達水平顯著下降，而來自同一個轉錄本(pri-miR-200c~141)的miR-200c不受影響。當細胞解離時，放線菌素D對轉錄的阻斷導致miR-141的迅速耗盡，半衰期不到1小時，從而表明miR-141是通過高速衰減而導致表達水平發生迅速改變的。在進一步的研究中，研究人員通過其他的miRNA包括miR-200a, miR-34a, miR-29b, miR-301a, 和 miR-21再次驗證了這一調控機制。(詳細報道請看：http://www.ebiotrade.com/newsf/2011-9/2011926123556850.htm)

　　然而，Narry Kim研究小組近日撤回了該文章。她們在撤回聲明中寫道：“基于我們的結果，我們認為，一些miRNA會根據細胞的粘附狀態而選擇性喪失穩定性。然而，在后續研究中，我們發現，低GC含量的miRNA(如miR-141、miR-29b、miR-21、miR-106b、miR-15a和miR-34a)會在樣品制備階段選擇性丟失，而不是在細胞中降解。”

　　此外，Kim及她的同事還發表了新的數據，將TRIzol RNA分離方法與另一種不太常用的mirVana方法進行了比較，應用在高密度和低密度細胞樣品上。利用TRIzol，她們發現，低密度培養物中的 miR-141水平低于高密度培養物。然而，利用mirVana方法，兩者只有輕微的差異。

　　作者認為，兩個操作步驟的數據不一致提出了一個嚴重的問題，即某些miRNA可能在RNA制備過程中丟失，這取決于選擇的操作步驟。

　　Kim談道：“科學家不可避免地會承認一些假設，而它們后來被證明是錯誤的。我們也存在一些技術限制，而在研究的時候未被發現。因此，得出錯誤的結論有時是不可避免的。最重要的是要誠實，一旦我們意識到，就要糾正錯誤。”

　　對于miRNA的分離，很多實驗室都是使用TRIzol試劑。但從這篇文章的結論來看，TRIzol很可能會影響部分實驗結果。吸取Narry Kim的教訓，大家最好還是采用兩種分離方法，來驗證結果的可靠性。同時，希望Life Tech的研發部門好好研究一下，發布更為可靠的操作步驟。