研究基因的表達和調控時常常要從組織和細胞中分離和純化RNA。TRIzol RNA提取方法:(1)操作簡單的,提取方便,回收率高; (2)提取的RNA的質量高,對cDNA庫,RT-PCR和Northern?Blot等分子生物學實驗起著很重要的影響。
實驗方法原理 | Trizol是一種新型總RNA抽提試劑,采用變性劑即內含異硫氰酸胍酚和β-巰基乙醇等變性物質,能迅速破碎細胞,抑制細胞釋放出的核酸酶。異硫氰酸胍屬于解偶劑,是一類強力的蛋白質變性劑,可溶解蛋白質,并使蛋白質二級結構消失,細胞結構降解,核蛋白迅速與核酸分離。β-巰基乙醇主要破壞RNase蛋白質中的二硫鍵。 細胞裂解后,細胞釋放出蛋白質、DNA、RNA等物質,再根據它們在不同的PH值和不同極性溶劑的溶解度不同而使得分開。
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實驗材料 | 細胞樣品 |
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試劑、試劑盒 | TRIzol試劑氯仿異丙醇75%乙醇DEPC H2O |
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儀器、耗材 | 離心管離心機EP管勻漿器移液管冰袋漩渦振蕩器 |
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實驗步驟 | 1. 樣品處理:
(1) 培養細胞: 收獲細胞1-5×107,移入1.5ml離心管中,加入1ml Trizol,混勻,室溫靜置5min。
(2) 組織:取50-100mg組織(新鮮或-70℃及液氮中保存的組織均可)置1.5ml離心管中,加入1ml Trizol充分勻漿,室溫靜置5min。
2. 加入0.2ml氯仿,振蕩15s,靜置2min。
3. 4℃離心,12000g×15min,取上清。
4. 加入0.5ml異丙醇,將管中液體輕輕混勻,室溫靜置10min。
5. 4℃離心,12000g×10min,棄上清。
6. 加入1ml 75%乙醇,輕輕洗滌沉淀。4℃,7500g×5min,棄上清。
7. 晾干,加入適量的DEPC H2O溶解(65℃促溶10-15min) 收起 |
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注意事項 | 1.樣品量和Trizol的加入量一定要按步驟(1)的比例,不能隨意增加樣品量或減少Trizol量,否則會使內源性RNase的抑制不完全,導致RNA降解。
2.實驗過程必須嚴格防止RNsae的污染。 |
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其他 | 一、RNA的定量計算
1. RNA定量方法與DNA定量相似。RNA在260nm波長處有最大的吸收峰。因此,可以用260nm波長分光測定RNA濃度,OD值為1相當于大約40μg/ml的單鏈RNA。如用1cm光徑,用 ddH2O稀釋DNA樣品n倍并以ddH2O為空白對照,根據此時讀出的OD260值即可計算出樣品稀釋前的濃度:
RNA(mg/ml)=40×OD260讀數×稀釋倍數(n)/1000
2. RNA純品的OD260/OD280的比值為2.0,故根據OD260/OD280的比值可以估計RNA的純度。若比值較低,說明有殘余蛋白質存在;比值太高,則提示RNA有降解。 |
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