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    中科院GenomeResearch發表環狀RNA新成果

    早在幾十年前,生物學家們就發現了環狀RNA(circRNA)。環狀RNA呈封閉環狀結構,不受RNA外切酶影響不易降解,比線性RNA穩定得多。隨著二代測序的發展,人們逐漸意識到環狀RNA其實是非常普遍的。這些分子廣泛存在于多種生物的細胞中,從古生菌、酵母、小鼠到人類。 環狀RNA通常表達水平比較低,但它們的表達存在細胞和組織特異性。近年來的研究表明,環狀RNA可以通過不同途徑影響基因表達,有效擴展真核細胞轉錄組的多樣性和復雜性。這種內源RNA分子已經成為了生物學領域的新熱點。 環狀RNA來自于外顯子的反向剪接。通過選擇性反向剪接和選擇性剪接,一個基因位點可以生成多個環狀RNA。中科院上海生命科學研究院的楊力(Li Yang)研究員領導團隊,為環狀RNA的選擇性反向剪接和選擇性剪接繪制了詳細圖譜。這項研究發表在七月一日的Genome Research雜志上。 研究人員對此前開發的計算分析流程進行了升級(CIRCexplor......閱讀全文

    云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用(二)

    4.對年齡相關性白內障circRNA的分析顯示,circZNF292可以通過海綿機制調節miR-23b-3p功能發表期刊:Aging-us影響因子:4.831發表時間:2020.9.10研究方法:全轉錄組測序、qRT-PCR、RIP、RNA pull down、雙熒光素酶實驗等云序提供文章鏈接:Pr

    云序環狀RNA研究策略在環狀RNA研究的應用(一)

    環狀RNA作為新發現的RNA分子,從誕生之日起就是光環加身,屢屢登上Science、Nature、Cell等高分期刊。近期發表的《2019研究前沿》中,“環狀RNA作為癌癥新的生物標志物”成為生物科學領域6個新興前沿之一。2019年環狀RNA共發表SCI論文885篇,較2018年增長約20%,其中大

    環狀 RNA 測序案例分析

    案例:以結腸癌,卵巢癌,特發性肺纖維化及正常的人組織為例探討 circular RNAs 的富集與增殖的相關性 背景:最新研究表明,circular RNAs 大量存在,是構成生物體 RNA 網絡的一部分,而且研究者們推測 circular RNAs 與 miRNAs 一樣具有生物學功能。 目的

    環狀RNA研究深度剖析

      1.環狀RNA為什么火?它到底是何方神圣?   2013年兩篇Nature[1][2]文章的出世,徹底顛覆了我們對RNA的傳統認知,同時也迅速引爆了整個生物醫學界!經過嚴格統計匯總后,2017年國家自然科學金獲批的項目中環狀RNA研究相關的項目總數高達176項,其中有兩項杰出青年基金,一項優秀

    環狀RNA結合功能蛋白

    環狀RNA作為研究持續火熱的明星分子,不同于對其豐富的表達譜研究,環狀RNA功能機制研究還僅僅處在起步階段。環狀RNA研究多為miRNA海綿機制,部分circRNA可競爭性結合miRNA,解除miRNA對靶基因的抑制作用,上調靶基因的表達。其實,環狀RNA可以通過結合不同種類的功能蛋白,分別在轉錄前

    環狀RNA研究方法(二)

    在此基礎上,哪些環狀RNA分子發生了差異表達?在這里火山圖、Venn圖應有盡有。根據p=2的標準,一共發現42個環狀發生上調,47個環狀發生下調。?圖3. 差異環狀RNA的篩選2. 差異環狀RNA分子的qPCR驗證對于一篇做譜的文章,差異環狀RNA的結果驗證只需做到qPCR即可。對5個上調和5個下調

    環狀RNA研究方法(一)

    至2015起云序生物已經完成10000+例環狀RNA全轉錄組測序服務,涵蓋了50+疾病,20+物種,幫助眾多客戶在環狀RNA分子的研究中取得突破性進展。客戶發表的環狀RNA文章高達20篇以上。此外云序生物還提供環狀RNA機制研究手段,rip&RNA pull down技術,幫助客戶沖刺高分機制文章。

    環狀RNA研究文章匯總(一)

    環狀RNA“一站式”服務一直以來是云序生物的主打產品,嚴格的質控把關、嚴謹的實驗設計、出色的生信分析以及貼心的售后服務造就了多項世界首篇環狀RNA研究文章,受到了廣大客戶的一致好評。迄今為止,云序已經積累了超過10000例環狀RNA測序的經驗,樣本覆蓋20多個物種以及50多種疾病,客戶發表文章達20

    環狀RNA研究深度剖析(一)

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    環狀RNA研究文章匯總(二)

    4.世界首篇人膠質瘤環狀RNA研究(影響因子:3.0)膠質瘤作為最常見的顱內惡性腫瘤占顱腦腫瘤的40%~50%,電磁輻射等其他環境致癌因素會導致膠質瘤的發生,盡管手術切除、術后放療、藥物化療等方法可以作為主流的膠質瘤治療手段,但是多形性膠質母細胞瘤(GBM)的強侵襲、增殖能力仍給病人的治療造成很大的

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