NatureMethods公布最大人類蛋白互作網絡
一個國際研究小組公布了迄今為止最大的蛋白互作數據庫資源,這將有助于解析眾多疾病相關的基因如何促發疾病發生和進程的。這項研究由麻省總醫院MGH和Broad研究院領銜完成,相關數據庫: InWeb_InBioMap (InWeb_IM) 在線公布在11月28日Nature Methods雜志上。“現代遺傳學技術能幫助我們對癌癥或者精神疾病患者的基因組進行常規測序,但是科學家們依然不是很了解受到疾病相關遺傳突變影響的細胞系統,”文章作者之一,Broad研究院項目負責人之一Kasper Lage博士說,如果有更完整的人體蛋白物理相互作用圖譜,將能幫助我們探索細胞進程,更高分辨分析疾病的影響。雖然繪制大規模蛋白互作網絡的重要性已經是共識了,但是大部分近期的實驗針對的都是少于30,000個直接相互作用,從最保守的估計來說,這只代表了四分之一的相互作用總數。Lage研究組與丹麥,英國的科學家們合作,研發了一個計算機框架,能從超過43,000篇......閱讀全文
基因組所完成開發RiceWiki數據庫
近日,中國科學院北京基因組研究所章張研究員課題組與北京理工大學、中國林業科學研究院及華中農業大學合作開發完成RiceWiki數據庫。該數據庫是基于維基百科的水稻基因信息平臺,是可編輯且內容公開的公眾注釋系統。研究成果在Nucleic Acids Research雜志發表。 水稻是人類重
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0,并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題,在線發表在Nucleic Acids Rese
北京基因組所發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0
中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心發布表觀基因組數據庫MethBank 3.0,并將其成果以MethBank 3.0: a database of DNA methylomes across a variety of species為題,在線發表在Nucleic Acids Rese
全球藥典草藥基因組數據庫已上線
近期,中國中醫科學院中藥研究所團隊建立了全球藥典基因組數據庫(GPGD)。該數據庫是全球首個針對藥典收載草藥物種的大型基因組學數據庫。相關研究成果發表在《Science China-Life Sciences》雜志,標題為“Global Pharmacopoeia Genome Database
科學家搭建草莓基因組數據庫
原文地址:http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2021/3/454861.shtm 草莓為薔薇科草莓屬,因芳香多汁、營養豐富受到喜愛,在全國各地均可種植。栽培草莓為異源多倍體,基因組復雜,雜合度高。 2019年,《自然—遺傳學》發表了利用三代測序數據組裝的高
北京基因組所構建完成質體基因組結構變異數據庫
多相催化是實現高效定向化學轉化的關鍵技術,其中的一個重要基礎科學問題是如何通過精確設計和調控催化活性位結構及所在環境,從而強化其定向催化功能并創造新型高效催化劑。近日,中國科學技術大學熊宇杰教授課題組和江俊教授課題組繼在電催化體系中提出表面極化概念后,再次通過與黃偉新教授課題組合作,證實界面極化
北京基因組所開發系列特色科學數據庫
近日,中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇數據庫文章在國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)雜志在線發表,并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas
北京基因組所開發系列特色科學數據庫
近日,中國科學院北京基因組研究所生命與健康大數據中心(BIG Data Center,BIGD)有七篇數據庫文章在國際學術期刊《核酸研究》(Nucleic Acids Research)雜志在線發表,并將于該刊2019年1月出版的數據庫專刊中集中刊發。包括表觀組關聯分析知識庫EWAS Atlas
橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺完成測試
本報訊 日前,中國熱帶農業科學院“橡膠樹等主要熱帶作物功能基因組學研究”創新團隊負責搭建的橡膠樹HeveaDB基因組數據庫平臺(hevea.catas.cn)上線運行,并在國際橡膠研究與發展委員會(IRRDB)各成員國間開展測試工作。經過1個月的測試,數據庫平臺各項指標保持穩定,運行可靠,達
武漢科研團隊破譯并公布蓮基因組數據庫
近日,武漢市園林科學研究院和中科院武漢植物園攜手研發出破譯荷花遺傳密碼的蓮基因組數據庫。日前,該數據庫在國際知名學術期刊公布,供各國荷花研究人員免費共享。 據介紹,水生植物蓮是地球上最早出現的開花植物之一。研究發現,早在約1.4億年前蕨類植物和恐龍稱霸地球的時代,在北半球許多水域已有蓮的分布。