MolecularOncology:廢物利用!新方法使乳腺癌診斷更精準
一項發表在《Molecular Oncology》上的新研究表明對乳腺癌常規檢測剩下的組織進行蛋白質和RNA檢測可能會使檢測結果更準確。圖片來源于網絡 通過使用細針抽吸25名乳腺癌病人和33名良性腫瘤病人的組織樣品,研究人員發現通過蛋白質和RNA分析竟然可以完全將所有惡性腫瘤病人和良性病人區分開。 這項研究表明除了提供結論性診斷信息之外,通過微創技術對乳腺癌進行分型很重要,這樣有助于決定每個病人最適合的療法、監控疾病進程以及對治療的反應。......閱讀全文
Nature:小分子RNA調控免疫系統抗擊乳腺癌
日前,英國科學家在《自然》雜志上發表論文稱,人體自身免疫系統對抗乳腺癌是由小分子RNA控制,后者對不同乳腺癌亞型的影響是不一樣的。 此前劍橋大學在2012年發表的一項研究表明,乳腺癌可以細分成十個不同的遺傳亞型,此后研究人員一直在尋找這些不同類型乳腺癌與小分子RNA行為模式之間的關系。
TRIzol法同時提取RNA、DNA、蛋白質
TRIzol試劑適用于從細胞和組織中快速分離RNA。TRIzol試劑有多組分分離作用,與其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、鹽酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特點是可同時分離一個樣品的RNA\DNA\蛋白質.TRIzol使樣品勻漿化,細胞裂解,溶解細胞內含物,同時因含有RNase抑制劑可保持RNA
TRIzol法同時提取RNA、DNA、蛋白質
TRIzol試劑適用于從細胞和組織中快速分離RNA。TRIzol試劑有多組分分離作用,與其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、鹽酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特點是可同時分離一個樣品的RNA\DNA\蛋白質.TRIzol使樣品勻漿化,細胞裂解,溶解細胞內含物,同時因含有RNase抑制劑可保持RNA
中科大研究發現小分子RNA可以抑制乳腺癌
中國科學技術大學生命學院柳素玲教授在腫瘤干細胞領域研究中取得新突破,發現一種叫做 microRNA100(miR-100)的核糖核酸小分子可以抑制乳腺腫瘤干細胞的更新和增殖,從而扼制乳腺癌的生長和遷移。相關論文以長文形式于近日在線發表在國際著名學術期刊《癌癥研究》上。 在此項研究中,中國科大科
RNA-蛋白質的相互作用1
葉綠體RNA的體外加工與紫外交聯分析RNARNA的合成l??????DNA模板的線性化1.根據供應商的指導用合適的限制酶酶解含有DNA模板(如亞克隆在轉錄載體如pBluescript?(Stratagene)上的菠菜葉綠體psbA基因)的質粒(Schuster and Gruissem1991)。2
《Nature》RNA調節蛋白質合成的隱藏信號
RNA以A、U、C和G等基本核苷酸在細胞的蛋白質加工廠中指揮蛋白質生產。為了制造蛋白質,機器的一端先鎖定在RNA上,然后掃描整條RNA,直到AUG字符串后停止掃描,AUG是將遺傳密碼翻譯成蛋白質的開始信號。 在巡查第一個AUG位點時,蛋白質制造機器經常會遇到一個與AUG不同的字符串(如AUA)
TRIzol法同時提取RNA、DNA、蛋白質4
注意事項:1. DNA在中間層和有機相中時可在2~8℃保存過夜。2.DNA沉淀在75%乙醇中2~8℃可保存幾個月。3.DNA在8mM NaOH溶液中4℃可放置過夜,如長期保存需用HEPES調節pH至7~8并且加EDTA至1mM,可置于4℃或-20℃長期保存。常見問題分析:得率低:A.樣品勻漿和裂解的
TRIzol法同時提取RNA、DNA、蛋白質3
DNA污染:A. 樣品勻漿時加的試劑量太少。B.樣品中含有有機溶劑(如乙醇,DMSO等),強緩沖液或堿性溶液。蛋白聚糖和多糖污染:沉淀RNA的過程中作以下改進可去除這些污染,步驟7中,每使用1ml TRIzol在水相中加0.25ml異丙醇和0.25ml高鹽溶液(0.8M檸檬酸鈉和1.2MNaCl)混
RNA-蛋白質的相互作用2
葉綠體mRNA3’末端的體外加工l??????RNA加工反應1.在1.5ml微量離心管中加入下列反應液:緩沖液IVT(20×)????????????????????????????0.5μl葉綠體蛋白提取物(20μg)??????????????????????Lμl緩沖液E???????????
TRIzol法同時提取RNA、DNA、蛋白質2
5. 2-8℃10000×g離心15分鐘。樣品分為三層:底層為黃色有機相,上層為無色水相和一個中間層。RNA主要在水相中,水相體積約為所用TRIzol試劑的60℅。6. 把水相轉移到新管中,如要分離DNA和蛋白質可保留有機相,進一步操作見后。用異丙醇沉淀水相中的RNA。每使用1mlTRIzol加入0
TRIzol法同時提取RNA、DNA、蛋白質(一)
TRIzol試劑適用于從細胞和組織中快速分離RNA。TRIzol試劑有多組分分離作用,與其他方法如硫氰酸胍/酚法、酚/SDS法、鹽酸胍法、硫氰酸胍法等相比,最大特點是可同時分離一個樣品的RNA\DNA\蛋白質.TRIzol使樣品勻漿化,細胞裂解,溶解細胞內含物,同時因含有RNase抑制劑可保持RNA
TRIzol法同時提取RNA、DNA、蛋白質(二)
DNA的分離準備試劑:乙醇0.1M檸檬酸鈉(含10%乙醇)、 75%乙醇、8mM NaOH操作步驟:1. 樣品加氯仿分層后,移去上層水相,用乙醇沉淀中間層和有機相中的DNA。每使用1mlTRIzol加0.3ml無水乙醇混勻,室溫放置3分鐘,2~8℃不超過2000×g離心5分鐘。2. 移去上清,(如需
小分子RNA調控免疫系統-抗擊乳腺癌引起廣泛關注
英國科學家最近在《自然》雜志上發表論文稱,人體自身免疫系統對抗乳腺癌是由小分子RNA控制,后者對不同乳腺癌亞型的影響是不一樣的。 2012年英國劍橋大學科學家一項研究表明,乳腺癌可以細分成十個不同的遺傳亞型,此后研究人員一直在尋找這些不同類型乳腺癌與小分子RNA行為模式之間的關系。英
RNA蛋白質印跡法的技術應用
中文名稱RNA-蛋白質印跡法英文名稱Northwestern blotting定 義將經過電泳分離的蛋白質轉移到膜上再與某種特異的RNA探針雜交,是研究蛋白質與RNA特異結合的技術。應用學科生物化學與分子生物學(一級學科),方法與技術(二級學科)
酵母蛋白質和-RNA-的制備(稀堿法)
實驗概要本實驗介紹了從酵母中分離制備蛋白質和 RNA 的原理和方法。實驗原理酵母細胞富含蛋白質和核酸。用稀堿液(0.2% 的氫氧化鈉)處理酵母使細胞裂解,離心收集上清液,得到酵母核蛋白抽提液。用鹽酸調節抽提液 pH 至 3.0 (核蛋白的等電點),核蛋白溶解度下降大量沉出,離心收集沉淀物為酵母蛋白質
研究蛋白質RNA相互作用的新工具
近日,賽默飛世爾科技全新推出了一款Pierce Magnetic RNA-Protein Pull-Down Kit,讓研究人員能夠以末端標記的RNA作為誘餌,輕松富集蛋白質-RNA的相互作用。與抗體捕獲相比,這種方法的優勢在于脫硫生物素化的目標RNA能夠直接富集RBP(或復合物)。 蛋白
提取的DNA中含有蛋白質和RNA污染
提取的時候飽和酚,氯仿需要定量,這些可以去蛋白。去除RNA污染,RNA酶活性,定量。凝膠電泳,試劑最好是即用型的,因為有些東西放久了會長菌。然后是染料的熱穩定性和靈敏度。
C/D-RNA蛋白質復合物催化RNA核糖甲基化的結構機理
上海光源用戶研究發現C/D RNA蛋白質復合物催化RNA核糖甲基化的結構機理 1月27日,北京生命科學研究所葉克窮實驗室在《自然》雜志發表了題為Structural basis for site-specific ribose methylation by box C/D RNA
凝膠阻滯實驗分析RNA蛋白質作用常數實驗
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 凝膠阻滯實驗(gel reiardadon assay,又稱為 mobthty shift assay)方法簡單、靈敏,可以定量的特性使它在研究轉錄和基因調控中廣泛的應用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 結合蛋
凝膠阻滯實驗分析RNA蛋白質作用常數實驗
實驗方法原理 凝膠阻滯實驗(gel reiardadon assay,又稱為 mobthty shift assay)方法簡單、靈敏,可以定量的特性使它在研究轉錄和基因調控中廣泛的應用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 結合蛋白的純化,確定一種已知或可能的 RNA 結合蛋白所識別
凝膠阻滯實驗分析RNA蛋白質作用常數實驗
凝膠阻滯實驗(gel reiardadon assay,又稱為 mobthty shift assay)方法簡單、靈敏,可以定量的特性使它在研究轉錄和基因調控中廣泛的應用。目前通常用于 RNA ( 或 DNA ) 結合蛋白的純化,確定一種已知或可能的 RNA 結合蛋白所識別的序列,建立反應常數(如親
RNA翻譯與蛋白質折疊之間的微妙舞蹈
在蛋白質的合成過程中,RNA翻譯會影響蛋白質的折疊,而蛋白質折疊也會影響RNA的翻譯。 在過去的十年里,我們對細胞內蛋白質合成方式的認知取得了快速的增長,其中包括蛋白質合成的各個基本步驟:轉運RNA(transfer RNA, tRNA)是如何高保真、高速率地對信使RNA(messenger
蛋白質和脂質,RNA都可以糖基化
眾所周知,糖基化是在各種酶的作用下將糖添加到蛋白質或脂質中的過程。這個過程開始于內質網,結束于高爾基體。例如,糖在糖基轉移酶的作用下轉移到蛋白質上,與蛋白質上的氨基酸殘基形成糖苷鍵,最終形成糖蛋白。最近,一項名為“Small RNAs are modified with N-glycans an
Molecular-Oncology:廢物利用!新方法使乳腺癌診斷更精準
一項發表在《Molecular Oncology》上的新研究表明對乳腺癌常規檢測剩下的組織進行蛋白質和RNA檢測可能會使檢測結果更準確。 圖片來源于網絡 通過使用細針抽吸25名乳腺癌病人和33名良性腫瘤病人的組織樣品,研究人員發現通過蛋白質和RNA分析竟然可以完全將所有惡性腫瘤病
Nature:E鈣粘蛋白是多種乳腺癌轉移必需的蛋白質
轉移是癌癥患者死亡的主要原因。根據體外遷移與E-鈣粘蛋白水平的負相關關系,有人提出細胞間黏附蛋白E-鈣粘蛋白丟失后,周圍組織的侵襲和轉移就開始了。然而,這一假設與大多數乳腺癌為浸潤性導管癌并在原發腫瘤和轉移中表達E-鈣粘蛋白的觀察結果不一致。 為了解決這個現象和理論矛盾的問題,來自美國約翰霍普
Cell-Research:研究發現病毒RNA與宿主蛋白質互作網絡
RNA病毒是一類以RNA為遺傳物質的病毒。許多RNA病毒可以感染人類并引起疾病,比如冠狀病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黃病毒屬(如寨卡病毒,ZIKV;登革熱病毒,DENV)、絲狀病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,比
在蛋白質合成中涉及到主要的RNA是哪些?
1、信使RNA(mRNA)功能:攜帶著決定氨基酸排列順序的信息,在蛋白質合成過程中起模板作用。2、轉運RNA(tRNA)功能:轉運特定的氨基酸,識別信使RNA上的遺傳信息。3、核糖體RNA(rRNA)功能:是組成核糖體的成分。核糖體是蛋白質合成的場所。不同的組織細胞具有不同的生理功能,是因為它們表達
Science聚焦:球形RNA讓RNA療法重獲新生
幾十年來,RNA療法在治療遺傳疾病的道路上走得并不順遂。不過,隨著新型RNA(球形核酸SNA)在人體試驗中取得成功,這一領域似乎煥發出新的活力。Science網站特別撰文介紹了這項重要突破。 RNA療法一般是用反義RNA破壞疾病相關蛋白的生產。在美國化學學會(ACS)上周的一次會議上,研究人員
Milo單細胞蛋白質檢測技術解析乳腺癌發生的細胞基礎
乳腺癌起源于乳腺上皮細胞,原因是乳腺上皮細胞發生基因改變,導致隨后組織穩態的喪失。科學家們經過大量研究將乳腺上皮細胞分為幾個不同的亞群,但依然無法完全了解上皮細胞異質性和分化譜加州大學歐文分校(University of California, Irvine)的科學家,在最新一期Nature Com
Cell子刊:研究發現病毒RNA與宿主蛋白質互作網絡
RNA病毒是一類以RNA為遺傳物質的病毒。許多RNA病毒可以感染人類并引起疾病,比如冠狀病毒(如新冠病毒,SARS-CoV-2)、黃病毒屬(如寨卡病毒,ZIKV;登革熱病毒,DENV)、絲狀病毒(如埃博拉病毒,EBOV)以及流感病毒(Influenza virus)等。由RNA病毒引起的疾病,