蛋白質組學實驗技術大全
每一個領域的發展都是基于技術的進步和革新，蛋白質組學亦然。蛋白質的可變性和多樣性等特殊性質導致了蛋白質研究技術遠遠比核酸技術要復雜和困難得多，但正是這些特性參與和影響著整個生命過程。在開始實驗之前，先看看這篇技術簡介吧。一 蛋白質與DNA相互作用在許多的細胞生命活動中，例如DNA復制、mRNA轉錄與修飾以及病毒的感染等都涉及到DNA與蛋白質之間的相互作用的問題。隨著重組DNA技術的發展，人們已分離到了許多重要的基因。現在的關鍵問題是需要揭示環境因子及發育信號究竟是如何控制基因的轉錄活性的。為此需要：1. 鑒定分析參與基因表達調控的DNA元件；2. 分離并鑒定這些順式元件特異性結合的蛋白質因子。這些問題的研究都涉及到DNA與蛋白質之間的相互作用。研究DNA-蛋白質相互作用主要包括以下實驗方法：1 凝膠遷移實驗（EMSA）EMSA主要基于蛋白-探針復合物在在凝膠電泳過程中遷移較慢的原理。根據實驗設計特異性和非特異性探針，當......閱讀全文
PNNL發表開源蛋白質組學軟件InformedProteomics
分析測試百科網訊 一則消息可能對蛋白組學研究者們最頭痛的事有一定的緩解。美國一機構介紹了一款用于分析鑒定完整蛋白質的新型開源軟件。 ProMex中的LS-MS特征查找，該功能是Informed-Proteomics軟件套件的第一個組件的特征檢測算法。 它被開發用于檢測完整蛋白質離子的同位素包膜
細菌表達蛋白質和樣本制備
一般直接用SDS凝膠加樣緩沖液裂解，具體方法如下：[試劑與設備]（1）表達待檢測蛋白質的細菌。（2）50mmoL／LTris-HCl（pH7.4）。（3）2xSDS凝膠加樣緩沖液：100mmol／L Tris—HCl（pH6.8）200mmol／L 二硫蘇糖醇（DTT）4％ SDS（電泳級）0.2％
MRM－Proteomics同Biodesix合作開發蛋白質組肺癌精準診斷法
蛋白質組學領頭公司MRM Proteomics和分子診斷公司Biodesix于近期簽署了一項合作協議。根據協議條款，MRM Proteomics將授予Biodesix使用其專有iMALDI技術的權利，以進一步推進其基于血液的肺癌診斷。在此之前，Biodesix的測試菜單包括GeneStrat?基因組
蛋白質組樣品制備程序1
一、樣品制備試劑的準備二、細菌細胞樣品的裂解處理步驟三、人培養細胞樣品的裂解處理步驟四、膜蛋白裂解方法步驟一、樣品制備試劑的準備1、裂解緩沖液儲備液的準備下述本樣品制備方法已經過優化, 并被證明配合使用PF-2D 試劑盒可獲得最佳的結果。您若選擇其他的樣品處理和細胞裂解方法，請務必避免使用離子型的表
蛋白質組樣品制備程序2
2）在4℃條件下以20000g的離心力冷凍離心60分鐘 （離心力務必達到或大于20000g）。3）移取上清溶液。若上清樣品不立即使用，則須儲存于-80℃（最佳條件）或-20℃的無霜冰箱中以防止蛋白質的降解。2、用初始緩沖液（Start buffer）交換處理細胞裂解液1）在上述細胞裂解液中，加入初始
蛋白質組學的樣品制備
想要研究蛋白質，首先要得到高度純化且具有生物活性的目的物質，因此，蛋白樣品的制備是重要前提。蛋白提取的質量和效果對后續的研究分析有重要影響。不同種類的樣本在制備過程中，存在一些差異，要根據樣本特征調整實驗方案和操作細節。基本原則樣品處理盡量簡單，減少蛋白損失；盡量避免蛋白的降解；盡可能提高樣品蛋白的
蛋白質印跡法所需樣本的制備方法
1、單層貼壁細胞總蛋白的提取：（1）倒掉培養液，并將瓶倒扣在吸水紙上使吸水紙吸干培養液（或將瓶直立放置一會兒使殘余培養液流到瓶底然后再用移液器將其吸走）。（2）每瓶細胞加3ml 4℃預冷的PBS（0.01M pH7.2～7.3）。平放輕輕搖動1min洗滌細胞，然后棄去洗液。重復以上操作兩次，共洗細胞
從鼠尾或其他小樣本中制備基因組DNA
實驗方法原理 這一簡單的實驗方案在成百上千的實驗室被廣泛應用于轉基因或基因剔除小鼠的基因型鑒定以及從小量培養的細胞或組織塊中提取 DNA。實驗材料 蛋白酶 K培養的細胞鼠尾或小鼠組織試劑、試劑盒 乙醇異丙醇酚氯仿異戊醇磷酸鹽緩沖溶液SNETTE儀器、耗材 Sorvall 離心機及 H1000B、SH
從鼠尾或其他小樣本中制備基因組DNA
這一簡單的實驗方案在成百上千的實驗室被廣泛應用于轉基因或基因剔除小鼠的基因型鑒定以及從小量培養的細胞或組織塊中提取 DNA。本實驗來源「分子克隆實驗指南第三版」黃培堂等譯。實驗方法原理這一簡單的實驗方案在成百上千的實驗室被廣泛應用于轉基因或基因剔除小鼠的基因型鑒定以及從小量培養的細胞或組織塊中提取
從鼠尾或其他小樣本中制備基因組DNA
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 這一簡單的實驗方案在成百上千的實驗室被廣泛應用于轉基因或基因剔除小鼠的基因型鑒定以及從小量培養的細胞或組織塊中提取 DNA。 實驗材料 蛋白
不同塑料樣本的制備
增塑劑分析時前的樣本制備 在聚合物中添加增塑劑的目的是更加方便地生產塑料制品。由于增塑劑具有潛在風險，因此，事先對增塑劑的效果進行正確分析很有必要，然而正確的試樣制備是得出正確分析結果的前提。 ? 圖1.經SM 300磨碎機和Cryomill球磨機粗磨和細磨后的橡膠鴨顆粒。
Protocol－for－Protein－Extraction－for－proteomics
Protocol for Protein Extraction10 % w/v TCA/ acetone/ 0.07 % v/v -MercaptoethanolPlant cells are rich in compounds that interfere with the 2DE separat
PROTEOMICS：OGalNAc糖基化修飾蛋白質的系統發現
近日，上海交通大學系統生物醫學研究院張延課題組在國際知名蛋白質組學研究期刊PROTEOMICS上發表題為《Systematic identification of the protein substrates of UDP-GalNAc: polypeptide N-acetylgalactos
簡化樣本制備的微波系統
用于樣本制備的多通道微波新技術 樣本制備過程中使用微波技術會得到意想不到的效果。它快速、堅固在食品生產過程中的監控中的作用就如塑料在工業領域中的作用一樣，結合了兩種技術的新系統擁有了更大的靈活性。 在過去幾年里，微波消解技術被廣泛地應用在元素分析時的樣本制備過程。如今，在現代化實
石蠟包埋組織樣本的制備
實驗材料組織胰蛋白酶試劑、試劑盒二甲苯乙醇生理鹽水儀器、耗材尼龍網實驗步驟1. 把石蠟包埋組織切成 40~50 μm 厚的組織片 3~5 片，或用乳缽研成 0.5 mm 直徑大小顆粒狀，放入 10 ml 的試管中。2. 加入二甲苯 5~8 ml 時，在室溫下脫蠟 1~2 d，視石蠟脫凈與否，更換 1
FDA的樣本制備方法舉例
?? （1）樣本的整理在測定生鮮農產品藥物殘留時，如果沒有特別指明，按照規定，應以整個農產品作為試樣。除了分析特定食品中特定藥物殘留外，一般不得洗滌、除塵、削皮。??? 水果：去掉水果的把、凹處和核。??? 香蕉：切掉兩頭。??? 芒果：去掉皮和核。??? 甜瓜：去掉皮、莖、籽，只分析食用部分。??
石蠟包埋組織樣本的制備
實驗材料 組織胰蛋白酶試劑、試劑盒 二甲苯乙醇生理鹽水儀器、耗材 尼龍網實驗步驟 1. 把石蠟包埋組織切成 40~50 μm 厚的組織片 3~5 片，或用乳缽研成 0.5 mm 直徑大小顆粒狀，放入 10 ml 的試管中。2. 加入二甲苯 5~8 ml 時，在室溫下脫蠟 1~2 d，視石蠟脫凈與否，
FFPE樣本核酸（DNA/RNA）制備
福爾馬林固定、石蠟包埋（FFPE）組織切片的存檔代表了珍貴且來源廣泛的生物醫學研究材料。隨著越來越多的研究人員轉向 FFPE 樣品的分子分析，開發特定的操作步驟，考慮這些樣品的獨特性質就變得越來越重要。QIAGEN 在 FFPE 樣本純化及下游檢測整個流程中都提供完善的解決方案。QIAamp
基于液質聯用的單細胞蛋白質組學研究進展
摘要????蛋白質是細胞功能的主要執行者，由于其無法在體外進行擴增，單細胞蛋白質組學技術相較單細胞基因組學和轉錄組學技術而言發展相對滯后。傳統的蛋白質組學技術可獲得大量細胞蛋白表達的平均值，但忽略了細胞亞型及細胞異質性等信息。單細胞水平的蛋白質分析有助于闡明細胞不同表型與異質性的分子基礎。隨著質譜儀
生物樣本蛋白質的提取
由于大部分蛋白質都能溶于水、稀鹽、稀酸或稀堿溶液,所以蛋白質的提取一般是以水溶液為主,其中鹽溶液和緩沖溶液對蛋白質的穩定性好、溶解度大,是提取蛋白質最常用的溶劑。當細胞粉碎后,用鹽溶液或緩沖溶液提取蛋白質時,應注意以下一些條件。(1)鹽濃度常用等滲鹽溶液,尤其以0.02～0.05mol/L磷酸緩沖溶
血液樣本采集和血涂片制備
?一、血液生理概要 要點1： 離體后的血液自然凝固，分離出來的淡黃色透明液體稱為血清。血液加抗凝劑后分離出來的淡黃色液體稱為血漿。血清與血漿差別是：血清缺少某些凝血因子，如凝血因子Ⅰ（纖維蛋白原）、Ⅱ（凝血酶原）、Ⅴ、Ⅷ等。 要點2： 全血適用于臨床血液學檢查，如血細胞計數、分類和形態學檢查
食品檢測樣本制備方法舉例
（1）樣本的整理 測定生鮮農產品藥物殘留時，如果沒有特別指明，按照規定，應以整個農產品作為試樣。除了分析特定食品中特定藥物殘留外，一般不得洗滌、除塵、削皮。水果:去掉水果的把、凹處和核。 香蕉:切掉兩頭。 芒果:去掉皮和核。 甜瓜:去掉皮、莖、籽，只分析食用部分。 堅果類:去掉殼
如果提升樣本制備效率和質量
樣品制備的目的有：1、為某研究需要提供少量原料，可以過制取樣品提供。2、新產品研發，通過制取樣品，對樣品進行分析判斷是否為需要的產品。3、通過樣品制備過程，獲取制備的各種工藝參數，設備情況，從而設計生產線進行產品生產。為了保證樣品制備的厚度、角度，選擇電鏡樣品制備需要它具有分辨率高和景深長等特點，且
如果提升樣本制備效率和質量
樣品制備的目的有：1、為某研究需要提供少量原料，可以過制取樣品提供。2、新產品研發，通過制取樣品，對樣品進行分析判斷是否為需要的產品。3、通過樣品制備過程，獲取制備的各種工藝參數，設備情況，從而設計生產線進行產品生產。為了保證樣品制備的厚度、角度，選擇電鏡樣品制備需要它具有分辨率高和景深長等特點，且
質譜樣本制備技術資料
試劑耗材： Milli-Q water、Non-powder gloves、Face mask、Hat、10μl and 200μl tips（eppendorf）、Menthol(Fisher M/4056/17)、Acetonitrile(Fisher A/0626/17)、Try
如果提升樣本制備效率和質量
樣品制備的目的有：1、為某研究需要提供少量原料，可以過制取樣品提供。2、新產品研發，通過制取樣品，對樣品進行分析判斷是否為需要的產品。3、通過樣品制備過程，獲取制備的各種工藝參數，設備情況，從而設計生產線進行產品生產。為了保證樣品制備的厚度、角度，選擇電鏡樣品制備需要它具有分辨率高和景深長等特點，且
食品檢測樣本制備方法舉例
(1)樣本的整理 測定生鮮農產品藥物殘留時,如果沒有特別指明,按照規定,應以整個農產品作為試樣。除了分析特定食品中特定藥物殘留外,一般不得洗滌、除塵、削皮。水果:去掉水果的把、凹處和核。? 香蕉:切掉兩頭。? 芒果:去掉皮和核。? 甜瓜:去掉皮、莖、籽,只分析食用部分。? 堅果類:去掉殼。? 菠蘿:
飼料樣本的采集、制備及保存
（一）樣本的采集采樣是飼料檢測的第一步。樣本包括原始樣本和化驗樣本。原始樣本來自飼料總體、化驗樣本來自原始樣本。四分法：將原始樣本置于一塊塑料布，提起塑料布的一角，使飼料反復多動混合均勻，然后將飼料展平、用分樣板或藥鏟、從中劃“十”字或以對角線連接，將樣本分成四等分，除去對角的兩分，將剩余的兩分，如
蛋白質組和蛋白質組學分析
?隨著人類基因 組計劃研究成果的公布，人們對基因的認識逐漸清晰，但基因數量的有限性和基因結構的相對穩定性，與生命現象的復雜性和多樣性之間存在巨大反差。如何了解眾多的基因與危害人類身心健康的疾病之間的關系，對生命科學研究者來說仍是一項長期而艱巨的任務。因此，作為生命活動的直接承擔者――蛋白質，成為后基
空間轉錄組測序樣本準備指南
一、外泌體研究熱度持續攀升 外泌體（exosome）是活細胞分泌的30-200nm的囊泡，在電鏡下具有非常明顯單層膜結構，通常為茶托型或一側凹陷的半球形。其主要來源于細胞內溶酶體微粒內陷形成的多囊泡體，經多囊泡體外膜與細胞膜融合后釋放到胞外基質中。多種細胞在正常及病理狀態下均可分泌外泌體，