淺談RTPCR實驗方法中常見污染問題及對策
李軻反轉錄-聚合酶鏈反應(RT-PCR)是一種體外核酸擴增技術,它具有特異、敏感、快速、簡便、重復性好、易自動化等突出優點,能在幾個小時內完成從一根毛發、一滴血、甚至一個細胞中擴增出足量的目的產物供分析研究和檢測鑒定,所以近年來RT-PCR技術被廣泛應用于人和動物的多種傳染病早期診斷。筆者一直從事實驗室動物疫病檢測工作,現就應用RT-PCR實驗方法過程中出現的一些常見污染問題做如下論述,僅共同行參考和探討。 RT-PCR實驗有三步:提取RNA、反轉錄(RT)、PCR擴增及擴增產物分析,在這一過程中,zui令人頭痛的問題是易污染,極其微量的污染即可造成假陽性。污染原因主要有以下幾個方面: 1、樣品間的交叉污染收集樣品的容器zui好使用一次性的,如重復使用,應在使用前應于180℃的高溫下干烤6小時或更長時間;樣品存放時要密封嚴實,以防外溢造成相互間的交叉污染;樣品在提取過程中離心管及吸樣槍頭zui好使用一次性的,以免不同實......閱讀全文
Troubleshooting for PCR and multiplex PCR
Troubleshooting discussion is based on the PCR protocol as described in the table below. All reactions are run for 30 cycles.COMPONENTVOLUMEFINALCONCE
多重PCR(Multiplex PCR)
一般PCR僅應用一對引物,通過PCR擴增產生一個核酸片段,主要用于單一致病因子等的鑒定.多重PCR(multiplex PCR),又稱多重引物PCR或復合PCR,它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的PCR反應,其反應原理,反應試劑和操作過程與一般PCR相同.??? 多
PCR簡介/PCR儀
PCR的要素基本的PCR須具備PCR儀圖冊1.要被復制的DNA模板 Template2.界定復制范圍兩端的引物Primers.3.DNA聚合酶Taq. Polymearse4.合成的原料(四種脫氧核苷酸)及水。 PCR儀工作原理利用升溫使DNA變性,在聚合酶的作用下使單鏈復制成雙鏈,進而達到基因復制
多重PCR(Multiplex PCR)
一般PCR僅應用一對引物,通過PCR擴增產生一個核酸片段,主要用于單一致病因子等的鑒定.多重PCR(multiplex PCR),又稱多重引物PCR或復合PCR,它是在同一PCR反應體系里加上二對以上引物,同時擴增出多個核酸片段的PCR反應,其反應原理,反應試劑和操作過程與一般PCR相同.??? 多
重疊PCR—overlap PCR
1、簡介?重疊PCR也是基本的PCR原理:變性-退火-延伸。不同的是在重疊PCR過程是兩個或者幾個片段重疊延伸之后,再進行指數擴增的PCR過程。 ?2、基本原理*步:PCR產生兩個或者幾個片段,這幾個片段之間必須有重疊區。?第二步:以兩個片段為例,見上圖,*步產生的兩個片段,A D鏈之間有互補,B
普通PCR梯度PCR 原位PCR 熒光定量PCR儀的區別
普通PCR儀: 一般把一次PCR擴增只能運行一個特定退火溫度的PCR儀,稱之為普通PCR儀,也就是傳統的PCR儀。如果要用它做不同的退火溫度則需要多次運行。如;(ABI 2720) 梯度PCR儀: 一次性PCR擴增可以設置一系列不同的退火溫度條件(通常12種溫度梯度)的稱
反轉錄PCR(RT-PCR, Reversed Transcript PCR)
1 原理 RT—PCR是一種將cDNA合成與PCR技術結合分析基因表達的快速靈敏的方法,主要用于對表達信息進行檢測或定量分析,還可以用來檢測基因表達差異而不必構建cDNA文庫克隆cDNA。RT-PCR的模板可以為總RNA或poly(A)+選擇性RNA。逆轉錄反應可以使用逆轉錄酶,以隨機引物、ol
直接原位PCR(In situ PCR)
原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術,使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞(爬片、甩片或涂片)或組織(石蠟、冰凍切片)上直接對靶基因片段進行擴增,通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。一、組織切片和細胞樣品的制備試劑與配置10%福爾馬林;二甲苯;PBS操
反向PCR (inverse-PCR)
? ? ? ? ? ? 實驗方法原理 反向PCR可用于研究與已知DNA區段相連接的未知染色體序列,因此又可稱為染色體緩移或染色體步移。這時選擇的引物雖然與核心DNA區兩末端序列互補,但兩引物3’端是相互反向的。擴增前先用限制性內切酶酶切樣品DNA,然后用DNA連接
直接原位PCR(In situ PCR)
原位PCR是原位雜交細胞定位和PCR的高靈敏度相結合的技術,使得靶基因檢測有了極大的改進。此技術是在細胞(爬片、甩片或涂片)或組織(石蠟、冰凍切片)上直接對靶基因片段進行擴增,通過摻入標記基團直接顯色或結合原位雜交進行檢測的方法。一、組織切片和細胞樣品的制備試劑與配置10%福爾馬林;二甲苯;PBS操