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小規模快速制備果蠅RNA 試劑、試劑盒 Northern 樣品緩沖液 lmol L 乙酸 酚 氯仿 DEPC 處理的水 GHCL 溶液 無水乙醇 實驗步驟 一 材料與設備1)Northern 樣品緩沖液：2.2mol/L 甲醛，1mol/LMOPS，50% 甲酰胺2)lmol/L 乙酸3) 酚：氯仿（1:1)4)DEPC 處理的......閱讀全文
Brenton Graveley是在2014年4月收到他的第一臺MinION測序儀的。他所在的康涅狄格大學實驗室是首批獲得Oxford Nanopore Technologies測序儀的客戶。盡管準確性不穩定，通量也不高，但Graveley和他的同事決定立刻就試試。 對于MinION，眾多討論
大約在十年前，2006年諾貝爾生理/醫學獎得主CraigMello和AndrewFire發現，他們能夠將短RNA 分子插入到線蟲中并沉默特定基因的表達。今天，研究人員也常常使用這種強大的RNA 干擾方法來研究哺乳動物系統中的特定基因功能。為了進行這種基因沉默實驗，研究人員通常需要依賴化學合成的RNA
1RNA i的發現RNA i是在研究秀麗新小桿線蟲（C. elegans）反義RNA （antisenseRNA ）的過程中發現的，由dsRNA 介導的同源RNA 降解過程。1995年，Guo等發現注射正義RNA （senseRNA ）和反義RNA 均能有效并特異性地抑制秀麗新小桿線蟲par
一個由奧地利和美國科學家組成的研究小組新發現了數百個與疼痛感有關的基因，這將有助于開發新的鎮痛藥。 研究還發現，在這些疼痛基因中，果蠅、實驗鼠和人類共有的一個特殊基因可能與“通感”有關，即一種感官體驗觸發另一種感官體驗的現象。 人們感覺疼痛的程度因人而異，基因對此有很大影響，但科學
相關專題隨著ncbi 數據庫各種資源的涌現，NCBI已經成為科研工作者必不可少的資料查找，數據分析的工具。那么NCBI數據如何使用，新手入門一步一步教你認識和使用NCBI數據庫。一 綜合數據庫NCBI數據庫集美國國立生物技術信息中心(National Center for Biotechnology
有的時候，一段非編碼DNA序列可產生一個獨特、新的(初治)基因，它起著其自身特殊的可能會幫助塑造該物種的作用。但在此之前，研究人員還一直不太了解這一過程是如何進行的。Li Zhao及其同事將先前未經描述的黑腹果蠅——即普通果蠅——株的睪丸轉錄組——即雄性性腺中的全套的RNA分子——與可公開獲
鹽酸胍可在裂解細胞的同時快速抑制 RNA 酶的活性，本方法利用這特點來分離果蠅 RNA試劑、試劑盒Northern 樣品緩沖液lmol L 乙酸酚氯仿DEPC 處理的水GHCL 溶液無水乙醇實驗步驟一 材料與設備1)Northern 樣品緩沖液：2.2mol/L 甲醛，1mol/LMOPS，50%
中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所楊力研究組受邀在《分子細胞》（Molecular Cell）發表了題為RNA structure switches RBP binding 的專評文章，對該刊同期發表的一項題為RNA sequence context effects measured in
中國科學院武漢病毒研究所周溪課題組在病毒調控宿主N端規則研究方面取得重要進展。 細胞內蛋白質“壽命”（half-life）存在較大差異。一般來講，負責細胞必要結構的蛋白比較長壽，而負責信號調控的蛋白壽命往往較短。20世紀80年代，美國麻省理工學院教授Alexander Varshavsky總結
中國科學院武漢病毒研究所周溪課題組在病毒調控宿主N端規則研究方面取得重要進展。 細胞內蛋白質“壽命”（half-life）存在較大差異。一般來講，負責細胞必要結構的蛋白比較長壽，而負責信號調控的蛋白壽命往往較短。20世紀80年代，美國麻省理工學院教授Alexander Varshavsky
7月28日，來自中科院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組、上海巴斯德研究所郝沛研究組以及密歇根州立大學王紅兵教授，在國際著名遺傳學期刊《PLOS Genetics》發表一項合作研究，題為“The Landscape of A-to-I RNA Editome Is Shaped by
人類與果蠅的心跳都依賴于一種微小的基因，由于它們長度很短，常常被人們忽略。這一類基因所編碼的蛋白質僅有30個氨基酸甚至更少，屬于一個神秘的序列組群，叫做小開放閱讀框(smORFs)。 人類基因組包含成千上萬的smORFs，但是由于長度太短，它們很難被鑒別。除了少數已被驗證的個例外，沒有人知
RNAi所產生的基因沉默具有如下特點：1)高效性。 Elbashir等在研究中發現分別為25 nmol/L與100 nmol/L的起始雙鏈RNA產生的結果是一樣的，只是高濃度起始的更有效些。將雙鏈RNA濃度降低到1.5 nmol/L時產生的基因沉默效果變化不大，只有當濃度降低到0.05 nm
幾十年來，果蠅一直是先天免疫研究的模式動物。在最新一期的Cell雜志上，加州大學舊金山分校Tassetto教授等人描述了抗病毒RNAi擴散的機制，通過反向轉錄的vDNA環和包含小RNA的外泌體全身傳播，相當于哺乳動物適應性免疫。 多細胞生物體內有效的抗病毒保護依賴于細胞和全身免疫。系統免疫介導
11月4日，清華大學醫學院倪建泉教授研究組在《美國科學院院刊》(PNAS)發表題為《高效及可遺傳性果蠅基因組Cas9編輯技術》(Optimized gene editing technology for Drosophila melanogaster using germline-speci
2月24日，國際學術期刊《細胞研究》（Cell Research）在線發表了中國科學院上海生命科學研究院生物化學與細胞生物學研究所陳玲玲研究組和計算生物學研究所楊力研究組的最新研究論文ADAR1 is required for differentiation and neural inducti
芳烴受體的抗菌作用 這篇論文顯示，芳烴受體（AhR，已知能識別環境毒素、自身分子和飲食成分）也是針對細菌的先天防衛系統的一個組成部分，充當來自肺病原體的有色毒力因子的一個直接傳感器。細菌配體與AhR的結合，會通過一個負反饋環促進它們降解，同時促進細胞因子和趨化因子的生成。AhR不足的小鼠對綠
2017年即將過去，這一年的非編碼RNA研究取得了很多重磅級成果。與早先的主要是在不同類型的疾病（癌癥）中大規模鑒定非編碼RNA，今年的研究是對非編碼RNA機制的更深入探索，給我們展現了作用方式更豐富多彩的非編碼RNA世界。圖片來源于網絡 一 長非編碼RNA（lncRNA） 長非編碼RNA是
傳統觀點認為，真核細胞中RNA結合蛋白（RBPs）通過它們的RNA結合結構域（如KH、RRM結構域等）與其靶RNA結合形成RNP復合物（RNA granules， RNA顆粒），從而調控靶RNA的命運和功能【1，2】。近來研究揭示，許多RBPs含低復雜度Low Complexity（LC）結構域
傳統觀點認為，真核細胞中RNA結合蛋白（RBPs）通過它們的RNA結合結構域（如KH、RRM結構域等）與其靶RNA結合形成RNP復合物（RNA granules，RNA顆粒），從而調控靶RNA的命運和功能。近來研究揭示，許多RBPs含低復雜度Low Complexity（LC）結構域。LC結構域
4月1日，Genes & Development 發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所徐永鎮研究組題為A conserved intronic U1 snRNP-binding sequence promotes trans-splicing in Drosophila
封面故事： 想與做背后的神經活動 在對神經活動的新模式多大程度上通過學習可以產生所做的一項研究中， Aaron Batista及同事對恒河猴利用運動皮層中不同活動模式學習如何控制電腦光標時的神經網絡重新組織進行了分析。一些新的神經活動模式比其他的更容易產生(相應于更容易學會的任務)，這些可從實
“我們分析了一個特殊的蛋白家族：muscleblind樣蛋白(muscleblind-like proteins，MBNL)，這種蛋白最先是在果蠅中發現的，”IRCM的RNA生物學研究部主任 éric Lécuyer說，“這些RNA結合蛋白，之前研究發現在肌肉和眼睛的發育過程中發揮了重要
高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變, 一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定, 因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變, 同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能, 所以又被稱
高通量測序技術技術的應用及前景 （作者：生物芯片上海國家工程研究中心 滕曉坤, 肖華勝） 高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變, 一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定, 因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃
高通量測序技術技術的應用及前景 （作者：生物芯片上海國家工程研究中心 滕曉坤, 肖華勝） 高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變, 一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定, 因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃
一、高通量測序的應用 高通量測序可以幫助研究者跨過文庫構建這一實驗步驟，避免了亞克隆過程中引入的偏差。 依靠后期強大的生物信息學分析能力，對照一個參比基因組（reference genome）高通量測序技術可以非常輕松完成基因組重測序（re-sequence），2007年van Orsouw
高通量測序技術是對傳統測序一次革命性的改變，一次對幾十萬到幾百萬條DNA分子進行序列測定，因此在有些文獻中稱其為下一代測序技術(next generation sequencing)足見其劃時代的改變，同時高通量測序使得對一個物種的轉錄組和基因組進行細致全貌的分析成為可能，所以又被稱為深度測序(de
作為最新的明星分子，環狀RNA的熱度與日俱增。環狀RNA到底火到了什么程度？從云序客戶捷報頻傳﹑研究成果不斷就可見一斑：上期我們剛剛介紹云序客戶發表了世界首個小鼠腦創傷模型外泌體環狀RNA的研究，整合了外泌體和環狀RNA兩大科研熱點。在探索新物種的環狀RNA研究上，云序客戶此前更是先后發表了全世
作為最新的明星分子，環狀RNA的熱度與日俱增。環狀RNA到底火到了什么程度？從云序客戶捷報頻傳﹑研究成果不斷就可見一斑：上期我們剛剛介紹云序客戶發表了世界首個小鼠腦創傷模型外泌體環狀RNA的研究，整合了外泌體和環狀RNA兩大科研熱點。在探索新物種的環狀RNA研究上，云序客戶此前更是先后發表了全世