定量代謝組學案列：用小分子代謝產物診斷腸癌
近年來，醫學領域的基礎研究日趨系統化和多學科交叉，系統生物學的迅猛發展翻開了臨床實踐、藥物研發的新篇章。作為國內較早涉足系統生物學研究的賈偉教授研究團隊，近年來應用代謝組學技術對各種臨床疾病的早期預測、診斷和預后的生物標志物進行了廣泛的研究，現以結直腸癌的系列研究為例介紹我們的研究進展。研究團隊首先采用氣相色譜質譜聯用、液相色譜質譜聯用分析方法，結合單維統計、多維統計的代謝組學研究技術，對I-IV期的64名腸癌患者和65名健康志愿者分別進行了血清和尿液代謝標志物的篩查，并進一步在擴大的研究對象101名腸癌患者和103名健康人中對所發現的潛在代謝標志物進行了驗證。 研究結果顯示，腸癌患者與健康人的血清代謝物組成具有顯著差異。腸癌患者的糖酵解通路中的兩個代謝產物丙酮酸和乳酸在血清中呈顯著性升高，三羧酸循環中的琥珀酸、異檸檬酸、檸檬酸中間產物呈下降趨勢；油胺在腸癌病人血清中的含量也有顯著性降低；尿素循環代謝物精氨酸、鳥氨酸和......閱讀全文
代謝組學在疾病診斷中的應用
代謝組學? （metabolomics）的出現是生命科學研究的必然。在20世紀90年代中期發展起來的代謝組學，是對某一生物或細胞中相對分子量小于1,000的小分子代謝產物進行定性和定量分析的一門新學科。代謝組作為系統生物學的重要組成部分，在臨床醫學領域具有廣泛的應用前景。 代謝產物是基因表達的最終
發根農桿菌用于生產次生代謝產物
利用植物細胞培養技術生產次生代謝物真正實現商品化生產的還為數甚少，其主要原因在于植物細胞生長緩慢，有些還需要激素維持，次生代謝物含量太低，以及生產能力不穩定等，因而工業化生產的成本太高。發根能合成植物特征的次生代謝產物，而且其含量往往比植物的含量還高，尤其是它的穩定性和生長迅速的特點是工業化生產
藻類及其代謝產物對水質的影響
? ? 受城市污水排放和農田徑流的影響，大量氮、磷等營養成分排入水體，致使水體富營養化，藻類過量繁殖。特別是我國南方地區的一些湖泊和水庫水，由于陽光充足、溫度較高，藻類成為主要問題。? ? 水中藻類嚴重影響給水處理效果，主要表現在以下幾方面：藻類一般帶負電，具有較高的穩定性，難于混凝；藻類比重小，沉
計算機輔助鑒定藥物代謝產物
隨著分析儀器的發展，單個代謝樣品中即可檢測到成千甚至上萬個化合物，如此龐大的數據亟需無監督的自動化鑒定過程。計算機的引入有效解決了大數據處理難題，同時加速了無標準譜圖化合物的解析過程，在一定程度上實現了藥物代謝產物的自動化鑒定。計算機輔助鑒定方法多種多樣，根據其工作原理，現分為化學結構數據庫基礎上的
細菌的分解代謝產物有哪些
細菌除能分解糖和蛋白質外，對一些有機物和無機物也可分解利用。各種細菌產生的酶不同，其代謝的基質不同，代謝的產物也不一樣。（1）對其他有機物的分解：如變形桿菌具有尿素酶，可以水解尿素，產生氨。乙型副傷寒沙門菌和變形桿菌都具有脫硫氫基作用，使含硫氨基酸（胱氨酸）分解成氨和H2S。（2）對其他無機物的分解
中藥基礎物質、代謝及代謝組學研究方案
中藥組成成分復雜、作用環節多樣，中藥藥效物質基礎以及臨床療效機理的闡明，已成為中醫藥現代化研究的重要內容。如何快速地從海量的質譜數據中獲取有價值的信息，減輕繁重的數據處理工作量，成為廣大中醫藥研究工作者的心聲。 賽默飛的Compound Discoverer軟件針對中藥成分鑒定、體內代謝轉化和
代謝組學－|－腫瘤治療之靶向葡萄糖代謝
能量代謝重編程是腫瘤的十大特征之一，其中葡萄糖代謝異常是腫瘤代謝最突出的特征。在氧氣充足的情況下，腫瘤細胞依然傾向于進行糖酵解，將葡萄糖代謝為乳酸。腫瘤細胞有氧糖酵解能力是正常細胞的20 ～ 30倍，為腫瘤代謝提供 大量能量和中間產物。因此，靶向糖酵解等異常環節的代謝酶是抗腫瘤治療的重點。一些研
微生物發酵代謝產物途徑中間產物的測定方法
先經分離純化得到你測純物質（≥95%），再進行質譜、核磁、同位素等的檢測，打出圖譜，然后再進行解譜，空間結構的話還需要一些的反應！很復雜！
琥珀酰化修飾組代謝組揭示水產動物病原菌代謝調控機制
隨著組學研究步入后基因組時代，蛋白質組、修飾蛋白質組、代謝組、多組學研究逐步向生命科學研究的各個領域滲透。盡管，相對于發展迅速的醫學等領域，水產科學中對修飾組等較新組學技術的應用起步較晚，但目前已有不少高質量文章發表，這為水產科學研究領域打開了新的研究視角。 本期，小編將為大家帶來一篇
琥珀酰化修飾組代謝組揭示水產動物病原菌代謝調控機制
隨著組學研究步入后基因組時代，蛋白質組、修飾蛋白質組、代謝組、多組學研究逐步向生命科學研究的各個領域滲透。盡管，相對于發展迅速的醫學等領域，水產科學中對修飾組等較新組學技術的應用起步較晚，但目前已有不少高質量文章發表，這為水產科學研究領域打開了新的研究視角。 本期，小編將為大家帶來一篇1
代謝組學科學哲學思路
代謝組學突出的是一種整體性的研究思路。它通過現代超高效液相色譜/高分辨質譜聯用儀等技術分析體液中的代謝物組成譜，并利用多變量統計分析技術，把所有代謝物的組成信息都整合到一起，為在系統和整體的層面上比較和分析生物的代謝特性。 眾所周知，西方醫學的哲學基礎是從分析開始的，如魏爾嘯的細胞論。隨著分析
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
代謝物組的定義
中文名稱代謝物組英文名稱metabolome定 義細胞內在某一特定生理和發育階段的所有小分子量的代謝物質。應用學科生物化學與分子生物學（一級學科），總論（二級學科）
代謝組學新工具：METLIN
METLIN是由美國Scripps研究院Gary J Patti和Gary Siuzdak開發出的新型數據庫，將能用于解決代謝組學等領域研究中關于數據處理這個大問題。 超過上萬個代謝物 目前METLIN包括有超過10,000個代謝產物中帶有詳細，高分辨率串聯質譜信息的六萬化合物，
代謝組學的研究方法
代謝組學的研究方法與蛋白質組學的方法類似，通常有兩種方法。一種方法稱作代謝物指紋分析 （metabolomic fingerprinting），采用液相色譜-質譜聯用（LC-MS）的方法，比較不同血樣中各自的代謝產物以確定其中所有的代謝產物。從本質上來說，代謝指紋分析涉及比較不同個體中代謝產物的質譜
質譜儀在代謝組學和代謝研究中有著杰出表現
質譜儀以離子源、質量分析器和離子檢測器為核心。離子源是使試樣分子在高真空條件下離子化的裝置。電離后的分子因接受了過多的能量會進一步碎裂成較小質量的多種碎片離子和中性粒子。它們在加速電場作用下獲取具有相同能量的平均動能而進入質量分析器。質量分析器是將同時進入其中的不同質量的離子，按質荷比m/e大小分
代謝組學前沿與熱點——定性代謝流解決方案
作為代謝組學領域先進解決方案的一貫領導者，安捷倫近期隆重推出了全新的定性代謝流解決方案—— MassHunter VistaFlux 工作流程，旨在關注代謝組學的前沿和熱點，提供更快、更準、更完整的高效工作流程，助力科研工作者拓展組學研究的精度與深度。 下面將從五個方面助您了解定性代謝流及安捷
Immunity：石榴的代謝產物可增強抗癌能力
結直腸癌（Colorectal Cancer，CRC）是全世界范圍內發病率第三的癌癥，每年新增發病人數近200萬（僅次于乳腺癌和肺癌），每年導致的死亡人數接近100萬（僅次于肺癌）。大約每25個人就有1人會在其一生中患上結直腸癌。 而在我國，結直腸癌年發病人數僅次于肝癌，2020年新增56萬結
細菌代謝產物的觀察實驗_糖發酵試驗
細菌的代謝產物大致可分為三類：一為可供鑒別細菌的產物；二為與細菌致病性有關的產物；三為可供治療用的代謝產物。實驗方法原理由于各種細菌具有不同的酶，故分解糖類的能力不同，分解糖類后的終末產物亦不一致，例如腸道非致病菌一般均有乳糖酶，能分解乳糖產酸(乳酸，甲酸，乙酸等)，尚有甲酸脫氫酶。能將甲酸進一步分
細菌合成代謝產物及其意義有哪些？
細菌合成代謝產物及其意義有哪些？（1）熱原質：大多數為革蘭陰性菌合成的菌體脂多糖。（2）毒素：◇內毒素：G-菌的脂多糖。◇外毒素：G+菌產生的蛋白質，毒性強且有高度的選擇性。（3）侵襲性酶：有些細菌還能產生具有侵襲性的酶，如卵磷脂酶、透明質酸酶等。注：毒素和侵襲性酶在細菌致病性中甚為重要。（4）色素
科研人員發布新型代謝產物鑒定工具
近日，中國科學院上海藥物研究所與中國科學技術大學杭州高等研究院合作，發布代謝產物鑒定工具DMetFinder。藥物及先導化合物在體內外的代謝過程往往十分復雜。傳統解析依賴人工經驗，耗時費力，還可能遺漏低豐度或非經典代謝物。DMetFinder為這些難題提供了新的解決方案。該工具融合余弦相似度算法、同
細菌代謝產物的觀察實驗——色素產生試驗
實驗方法原理有些細菌能產生色素，可作為鑒別某些細菌的根據。實驗步驟將金黃色葡萄球菌及綠膿桿菌分別劃線接種于瓊脂平板上，置37 ℃溫箱培養24 小時后，取出觀察兩菌所產生的色素。金黃色葡萄球菌的色素僅使菌落呈金黃色，屬脂溶性色素；綠膿桿菌的色素則彌散至培養基中，使整個培養物呈現綠色，屬水溶性色素。
嘌呤代謝異常診斷說明
血清尿酸增高，常為357～595μmol/L（6～10mg/dl）。尿中排出的尿酸過多，大于25mg/kg/24小時。尿酸/肌酐的比值增高，正常時小于1，病兒可達2～4比1。確診要靠酶活性測定，患兒紅細胞或皮膚成纖維細胞中HPRT活性減低或消失。腺嘌呤磷酸核糖轉移酶的活性為正常或增高。雜合子的檢出和
鈉代謝紊亂診斷要點
1.低鈉血癥(1.5～2.5mmol/L) 2.高尿鈉(>20mmol/L) 3.代謝性堿中毒(血漿HCO3->30mmol/L)。 4.高腎素血癥 5.高醛固酮血癥 6.對外源性加壓素不敏感 7.腎小球旁器增生 8.低氯血癥(尿氯>20mmol/L) 9.血壓正常。
嘌呤代謝異常診斷說明
血清尿酸增高，常為357～595μmol/L（6～10mg/dl）。尿中排出的尿酸過多，大于25mg/kg/24小時。尿酸/肌酐的比值增高，正常時小于1，病兒可達2～4比1。確診要靠酶活性測定，患兒紅細胞或皮膚成纖維細胞中HPRT活性減低或消失。腺嘌呤磷酸核糖轉移酶的活性為正常或增高。雜合子的檢出和
GCMS－HRAM－代謝組學數據庫－探索代謝組學的奧秘
鹽城4公分厚外墻巖棉板報價 巖棉制品是以精選的優質玄武巖為主要原料、經沖天爐熔化后，采用的四輥離心制棉工序，將玄武巖高溫熔體甩扭成4-7μm的非連續性纖維，再在巖棉纖維中加入一定量的粘結劑、防塵油、憎水劑，經過沉降、固化、切割等工藝，根據不同用途制成棉氈、半硬板、保溫帶、管殼等系列產品。
研究揭示直腸癌輔助放化療毒性血清代謝組學特征
原文地址：http://news.sciencenet.cn/htmlnews/2023/1/492737.shtm ?
質譜分析水楊酸（SA）中葡萄糖醛酸代謝產物定量方法...
質譜分析水楊酸（SA）中葡萄糖醛酸代謝產物定量方法開發的思考前言前幾天和一位友人討論他的畢業課題，其主要目的是定量分析其代謝物在尿液中的暴露量，其它的代謝物均完成了定量分析，但在葡萄糖醛酸代謝產物的定量上遇到了一些困難，現就對其方法開發中需要注意的問題跟大家分享下：藥物的葡萄糖醛酸代謝產物有2個SA
定量代謝分析在代謝類疾病治療與預防中的應用（二）
接下來，我們評估了MILLIPLEX?試劑盒檢測生物樣品的性能。?正如之前的預期，多種代謝激素水平會隨著食物的攝入而發生變化(血清中C-Peptide, GIP, active GLP-1與Insulin水平升高，如圖3A所示)。將匹配的人血清和血漿樣本進行比較，發現大多數分析物的血清和血漿
定量代謝分析在代謝類疾病治療與預防中的應用（一）
健 康?肥胖、糖尿病、心血管疾病以及其他代謝綜合征范疇內的相關疾病，是關系到我們健康最緊迫的問題，其中代謝相關的激素由內分泌系統的各個器官，包括脂肪細胞、胰腺和胃腸道分泌。在調節能量、食物攝取量和全身代謝方面發揮著重要作用。?近些年，隨著II型糖尿病的發病率上升，代謝類疾病甚至已經影響到兒童和青少年