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    張建之教授PNAS解析RNA編輯

    如果一些編碼位點的RNA編輯受損,就會引起嚴重的疾病。因此,一些人認為編碼性RNA編輯是對人體有利的。 近年來的基因組研究顯示,人類基因組中有超過一千個編碼位點受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)編輯。許多這樣的RNA編輯事件屬于非同義替換。 現在,科學家們在1,783個發生了上述RNA編輯的人類編碼位點中,分析了編輯事件的頻率和水平。他們指出,人類的編碼性RNA編輯一般是非適應性的。該文章于二月二十四日提前發表在美國國家科學院院刊PNAS雜志的網站上。 領導這項研究的是美國密歇根大學著名華人學者張建之教授。張建之教授早年畢業于復旦大學。1998年美國賓西法尼亞州立大學遺傳學博士畢業,師從著名的分子進化學家根井正利(Masatoshi Nei),現為美國密歇根大學生態學進化生物學系教授,是基因重復、適應進化等研究領域國際著名學者。 研究人員發現,隨著編碼位點重要......閱讀全文

    進化分析揭示編碼區和非編碼區RNA編輯的功能調控效應

      2017年3月,國際知名學術期刊PLOS Genetics在線發表了斯坦福大學Jin Billy Li課題組和中山大學生命科學學院張銳課題組共同研究的題為“Evolutionary analysis reveals regulatory and functional landscape of c

    基因編輯成進化發育生物學領域“殺手級”技術

    提塔利克魚模型與化石,該過渡期化石有助于解釋魚類如何開始長出四肢。圖片來源:Field Museum Library/Getty Images從1893年至今,幾乎在每年的夏季,年輕的發育和進化生物學者都會涌向美國馬薩諸塞州伍茲霍爾,鉆研業內的技術。在該校全球有名的海洋生物學實驗室中,參與其年度胚胎

    張建之教授PNAS解析RNA編輯

      如果一些編碼位點的RNA編輯受損,就會引起嚴重的疾病。因此,一些人認為編碼性RNA編輯是對人體有利的。   近年來的基因組研究顯示,人類基因組中有超過一千個編碼位點受到了RNA水平上的A(adenosine)-to-I(Inosine)編輯。許多這樣的RNA編輯事件屬于非同義替換。   現在

    上海生科院等揭示RNA編輯表觀遺傳位點的系統進化規律

      7月28日,PLOS Genetics 雜志發表了中國科學院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組題為The landscape of A-to-I RNA editome is shaped by both positive and purifying selection 的研究論文。

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    章魚藐視遺傳“中心法則”-頭足類動物RNA編輯程度令人吃驚

      章魚、魷魚和烏賊經常并不嚴格地遵循其DNA中的遺傳指令,相反,它們利用酶清除RNA中的特定堿基A(腺苷),并且利用一種不同的堿基I(肌苷)替代它們。大多數動物很少使用這種被稱作RNA編輯的過程重新編碼蛋白,但章魚等頭足類動物在超過半數的轉錄基因中編輯RNA。在一項新研究中,當研究人員定量和描述頭

    高效雙堿基編輯器研發成功并在水稻中實現基因定向進化

      近日,中國農業科學院作物科學研究所作物精準育種技術創新團隊成功開發了一種高效、編輯范圍更廣的胞嘧啶和腺嘌呤雙堿基編輯融合系統,利用該系統對水稻內源基因編碼區進行改造,獲得了高抗草甘膦的水稻新型基因資源。相關研究成果在線發表在《植物學報(Journal of Integrative Plant B

    遺傳發育所利用非編碼RNA揭示小麥多倍體形成與進化機制

      普通小麥是異源六倍體,染色體組分別為A組(來自烏拉爾圖小麥)、D組(來自粗山羊草)和B組(未確定但可能來自與S組相關的山羊草)。普通小麥形成經歷兩次雜交和兩次染色體組加倍過程。在這個過程中,染色體組加倍伴隨基因組沖擊而發生修飾或重組等。  中國科學院遺傳與發育生物學研究所韓方普研究組長期從事小麥

    中科院PLOS發表RNA編輯新成果

      7月28日,來自中科院上海生命科學研究院植物生理生態研究所李軒研究組、上海巴斯德研究所郝沛研究組以及密歇根州立大學王紅兵教授,在國際著名遺傳學期刊《PLOS Genetics》發表一項合作研究,題為“The Landscape of A-to-I RNA Editome Is Shaped by

    平行進化和趨同進化差異分析

    平行進化和趨同進化有些類似,二者的主要區別是:平行進化一般指親緣關系較近的植物種或植物類群,經過平行進化產生相似的特征;而趨同進化是指親緣關系較遠的植物種或

    張亞平院士JMCB獲人類大腦轉錄組進化研究進展

      人類在進化過程中,腦的大小和復雜程度得到了極大得增加。腦的結構使得人類有著區別于其他物種的極高的認知能力,比如語言能力、抽象思考能力等等。轉錄后修飾,如RNA編輯、可變剪切等能夠由相同的DNA序列生成不同的RNA,進而翻譯成不同的蛋白質構體,是擴大蛋白質多樣性的重要機制。隨著二代測序發展,轉錄后

    你,還在進化

    近700萬年前,現代人類從黑猩猩祖先進化中分離出來,但今天人們仍在繼續進化。在人類譜系中,已經有155個新基因被鑒定出來,這是由人類DNA的微小部分自發產生的。這些新基因中的一些可以追溯到哺乳動物的古老源頭,其中一些“微基因”被預測與人類特有的疾病有關。相關研究近日發表于《細胞報告》。 “這個項

    基因編輯技術可以編輯所有基因嗎

    即便當前不能,以后會能的。基因編輯技術指能夠讓人類對目標基因進行“編輯”,實現對特定DNA片段的敲除、加入等。在過去幾年中, 以ZFN (zinc-finger nucleases)和TALEN (transcription activator-like effector nucleases)為代表

    昆明動物所人類大腦轉錄組進化研究獲進展

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    堿基編輯技術治療鐮刀細胞貧血病

      鐮狀細胞病是一種常染色體隱性遺傳病,由 HBB 突變引起,通常編碼成人 β-珠蛋白(βA)。盡管同種異體造血干細胞 (HSC) 移植可以治愈 SCD,但通常無法獲得最佳匹配的供體,并且該手術可能導致移植排斥或移植物抗宿主病。  2021年6月2日,博德研究所David R. Liu(劉如謙)等團

    DNA堿基編輯:基因編輯工具“升級版”

      美國哈佛大學14日宣布,將授予光束療法(Beam Therapeutics,下稱BT)公司全球專利許可,對可用于治療人類疾病的一套革命性DNA堿基編輯技術進行開發和商業化。  BT公司同日宣布,已經籌集了高達8700萬美元由F-Prime資本和ARCH風投牽頭的A輪融資。BT公司由基因編輯技術領

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      美國哈佛大學14日宣布,將授予光束療法(Beam Therapeutics,下稱BT)公司全球專利許可,對可用于治療人類疾病的一套革命性DNA堿基編輯技術進行開發和商業化。   BT公司同日宣布,已經籌集了高達8700萬美元由F-Prime資本和ARCH風投牽頭的A輪融資。BT公司由基因編輯技

    選對學術編輯和責任編輯多么重要

    ?? 公開評審的期刊都會為每個稿件指定一個學術編輯或者責任編輯來評估稿件質量,通過了學術編輯的初審然后就是外審同行專家進一步評估,等返回了規定的有效審稿意見(一般至少2份)后學術編輯會評估審稿人的審稿意見是否可靠,然后再做出推薦和裁決。?? 很多時候不少作者只關注審稿人提出的意見而忽略了責任編輯提出

    著名華人科學家Science重大成果:首張全面的基因適應度景觀圖

       假設你正在試圖設計一種疫苗來對抗下一季的流感病毒。獲得一張能夠告訴你各種流感病毒株將如何進化的明細圖將會非常有幫助。  構建這類的圖譜是研究適應度景觀(fitness landscape)的進化生物學家們的一個目標,這一概念性工具為可視化及預測進化提供了一種方法。  適應度景觀這一概念出現于2

    STEME技術體系助力作物基因組編輯育種技術方法研究

      遺傳與變異是物種進化的基礎。通過物理、化學方法(如輻射誘變、EMS誘變)產生全基因組的隨機突變已經成為農作物育種的常規手段,但其中具有新型農藝性狀突變體的篩選較為費時、費力。定向進化(Directed Evolution)則通過創制目標基因的突變文庫,在施加一定選擇壓力下能夠快速獲得目的突變體。

    STEME實現植物基因的定向進化和功能篩選

      遺傳與變異是物種進化的基礎。通過物理、化學方法(如輻射誘變、EMS誘變)產生全基因組的隨機突變已經成為農作物育種的常規手段,但其中具有新型農藝性狀突變體的篩選較為費時、費力。定向進化(Directed Evolution)則通過創制目標基因的突變文庫,在施加一定選擇壓力下能夠快速獲得目的突變體。

    揭示伴侶進化之謎

      無論是配對還是成組,靈長類動物社會系統的成功也可能為人類社會生活的組織提供洞見。  研究人員分析了不同靈長類社會是如何進化的,以及哪些因素可能導致它們之間的轉變。研究結果表明,從獨居到群居的進化通常是從結對生活開始的。因此,結對生活是群體生活的基礎,在社會制度演變中起著至關重要的作用。相關論文近

    進化枝的概念

    進化枝(Clade)是指生命進化樹上包括祖先分枝和所有子代分枝(branch)總和的一個群體分枝。比如說,概述圖中藍色和紅色區域可以稱為clade,而綠色區域不可以,因為他是一個不完整的群體,藍色群體也是其子代。

    分子進化的概念

    分子進化(molecular evolution),生物進化過程中生物大分子的演變現象。主要包括蛋白質分子的演變、核酸分子的演變和遺傳密碼的演變。

    進化節奏的定義

    中文名稱進化節奏英文名稱tempo of evolution定  義進化過程中,物種在各個不同階段有不同的進化速率。應用學科遺傳學(一級學科),進化遺傳學(二級學科)

    進化趨勢的概念

    中文名稱進化趨勢英文名稱trend of evolution定  義在相對較長的時間尺度上,一個線系或一個單源群的成員表型進化改變的趨向。應用學科遺傳學(一級學科),進化遺傳學(二級學科)

    種系進化的定義

    中文名稱種系進化英文名稱phyletic evolution定  義一個物種沒有經過系譜分裂而整體逐漸形成新種的進化模式。應用學科遺傳學(一級學科),進化遺傳學(二級學科)

    共進化假說介紹

    共進化假說提出傳統的密碼是從原始的簡單密碼進化而來,密碼子的進化與氨基酸生物合成的進化是并列的。主要證據是這個原始的密碼可能是由64個密碼子通過高度簡并只編碼少量的氨基酸,而后的進化中,那些來自相關合成路徑的物理化學性質不同的氨基酸卻具有相似的密碼子,表明密碼子的進化與氨基酸生物合成具有密切相關性。

    腸道的進化起源

      消化系統、皮膚、肌肉組織是如何進化的呢?這個問題困擾了科學家一個多世紀。維也納大學的研究人員對海葵(一種非常古老的動物)胚胎發育的研究結果質疑了150年前提出的形成所有器官和組織的胚層具有同源性的假說。   該假說認為,身體中所有的器官和組織都來源于三個胚層之一,這些胚層在胚胎形成早期出現。這

    分子進化的起源

    在漫長的進化過程中生物的 DNA經歷了各種各樣的變化。包括基因突變、基因重組、染色體易位等。堿基置換突變常導致蛋白質中一個氨基酸的改變。例如正常血紅蛋白第 6位的谷氨酸改變為纈氨酸便成為鐮形細胞貧血癥的血紅蛋白 HbS,為賴氨酸替代則成為HbC,前者的堿基是從GAA(谷氨酸)→GUA(纈氨酸),后者

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