傳染病后腦炎為單相病程,癥狀和體征數天達高峰,與病毒感染有關,尤其麻疹或水痘病毒。腦脊髓炎也見于狂犬病、天花疫苗接種后,偶有出現在破傷風抗毒抗毒素注射后的報道。許多腦脊髓炎患者是繼發于普通的呼吸道感染,像EB病毒、巨細胞病毒和支原體肺炎病毒感染后。