苯丙酮尿癥（PKU）是一種先天性代謝障礙病，由苯丙氨酸代謝途徑中的酶缺陷所致，因患兒尿液中排出大量苯丙酮酸等代謝產物而得名。低苯丙氨酸飲食療法是治療PKU 唯一方法，以控制血中苯丙氨酸濃度在20-100 mg/L 之間，因此以低苯丙氨酸含量的高F 值低聚肽限制膳食中苯丙氨酸過多攝入就是行之有效的治療方法。此外，富含亮氨酸等疏水性氨基酸的寡肽，能刺激胰高血糖素分泌，降低膽固醇；增加甲狀腺素分泌，造成內源性膽固醇代謝亢進；促進糞便中甾醇排泄，降低血清膽固醇濃度。攝入含有大量支鏈氨基酸的蛋白肽類對酒精代謝有積極的作用。服用高BCAA 含量制劑還能緩解和減輕運動障礙性疾病病情，降低血糖。此外，高F 值寡肽還有抑制癌細胞增殖等作用。