遠端型RTA的病因可分原發性與繼發性兩類。原發性與遺傳有關，為常染色體顯性遺傳，有家族史，但多呈散發性。繼發性可由多種疾病引起，其最常見的原發疾病是慢性腎小管間質性腎炎，其中以慢性腎盂腎炎多見。此外，其他先天性遺傳性腎臟疾病如海綿腎，Fabry病，特發性高鈣尿癥等均可引起，繼發于舍格倫綜合征、系統性紅斑狼瘡等自身免疫性疾病的遠端型RTA有較高發生率，在棉產區因食用生棉籽油引起棉酚中毒所致DRTA也有報道。
