抗核抗體是一組對細胞核內的DNA，RNA，蛋白或這些物質的分子復合物的自身抗體。按其核內各個分子的性能不同可將各ANA區分開來，如(一)抗DNA抗體，（二）抗組蛋白抗體，（三）抗非組蛋白抗體，（四）抗核仁抗體等。每一大類又因不同抗原特性而再分為許多種類。因此ANA在廣義上是一組各有不同臨床意義的自身抗體，更確切的名稱應為抗核抗體譜。ANA 主要存在于IgG，也見于IgM、IgA，甚至IgD及IgE中。
常見的核免疫熒光杭核抗體試驗有以下幾種圖形：（1）均質型：核質染色均勻一致，這種染色型常與抗組蛋白和抗DNA抗體有關；（2）斑點型：核質染色呈斑點狀，抗可提取性核抗原（ENA）抗體常呈這種染色型；（3）周邊型：熒光染色圍繞在核膜周圍，它與抗DNA抗體有關；（4）核仁型：僅有核仁染色，具有抗4-6sRNA抗體呈現這種染色型；（5）著絲點型：在體外培養的細胞株（喉癌細胞）在核分裂相期時，可見到熒光染色的著絲點排列成特殊圖型，而在鼠肝做底物中看不到此類圖型，而被遺漏。
抗核抗體的分類
由于核抗原不同，有多種不同的ANA 。
抗核抗體抗DNA抗體
抗DNA抗體有抗雙鏈DNA（ds DNA）和抗單鏈(ss DNA)抗體之分。抗ds DNA抗體與SLE的關系密切，且隨疾病的活動度而升降，病情好轉者其滴度多下降甚或轉陰。抗ss DNA抗體則與抗ds DNA不同，可在多種疾病出現，包括一些非自身免疫性疾病，如細菌和病毒感染。故在臨床上無實用價值。而抗ds DNA抗體被認為是紅斑狼瘡（SLE）所特有。
抗DNA的自身抗體在SLE發病中起一定作用。在一些SLE患者，DNA大分子存在于循環中或粘附于多種器官的微血管結構，這些循環或器官原位抗原型DNA均可與循環自身抗體發生反應，形成免疫復合物，激活炎癥系統，在一些器官如腎臟，肺和腦組織引起免疫復合物介導的疾病，導致組織損傷。
抗可提取的核抗原（extractable nuclear antigen）抗體
此抗體原經鹽水或磷酸緩沖液處理，易從胞核中提取出來，且不含DNA。應用免疫熒光技術，抗ENA抗體型染色多呈斑點型。此類抗原分為九種，故產生九種相應抗體。
抗組蛋白抗體
組蛋白是一組堿性蛋白質，含有稍高量的賴氨酸及精氨酸。是與DNA形成的復合物，結合成DNA一組蛋白。組蛋白抗體見于藥物誘發的SLE。國外報道，用免疫熒光三步法測23例藥物致狼瘡陽性率為96%，12例SLE中42%陽性。北京協和醫院以同樣方法檢測488例服用異煙肼，68例服用苯妥英鈉，40例服用復降片（內含肼苯噠嗪），都在服用6個月以上者和另133例服他巴唑3個月以上者，無一例查到本抗體。這種差異可能與我國服用肼苯噠嗪和普魯卡因酰胺的患者較少之故，也不能除外人種不同而造成的差異。
抗核抗體抗著絲點抗體
其抗原為緊附于染色體著絲點的DNA蛋白質。因此需要選擇分裂相活躍的細胞作為底物，這種細胞的著絲點較易被暴露。多選用人喉癌上皮細胞（HEP-2），其優點是核大，分裂相多。國外報道本抗體多見于CREST綜合征（即表現為軟組織鈣化，雷諾現象，食管功能低下，指端硬化，毛細血管擴張）。陽性率達90%以上，稱之為CREST的標記抗體。根據協和醫院觀察測定結果，我國系統性硬化絕大部分是彌散型，CREST型極少見；抗著絲點抗體的陽性率在系統性硬化為20%，CREST型38%，彌散型10%，說明它不一定是CREST型的標記抗體。
抗核抗體抗核仁抗體
抗核仁抗體是一組對核仁不同RNA成分的抗體。由于成分（4-6sRNA）不同，因此構成斑塊，斑點，均質等不同圖型。本核體在以HEP-2細胞為底物間接免疫熒光檢查為明顯。醫院免疫組的陽性率是PSS38.5%，SLE6.1%，RA15.3%（陽性者都合并有指端硬化），SS8.6%，PM/DM10.0%，雷諾現象25%，其他結締組織病和正常人均陰性。抗核仁抗體不僅在PSS最多見，且滴度亦高，故它對PSS診斷有一定的幫助。
抗核抗體的檢測在自身免疫病的臨床診斷、鑒別診斷、評價療效和預后估計中具有較大的意義，因此常將抗核抗體的檢測作為自身免疫病的重要初篩試驗。