紅外光譜區通常是指波數(υ)為4000cm-1-200 cm-1的中紅外區，用這樣的紅外光通過樣品，再測量在各種波數下透過樣品的光強度，由儀器記錄下來的曲線，即為紅外光譜，其橫坐標是波數，縱坐標是光的透射率。紅外光譜圖上每一個吸收峰都相應于物質分子中原子或者官能團振動的情況。在糖類化合物結構研究中，紅外光譜可以區分吡喃糖和呋喃糖，確定多糖分子中各種吡喃搪的糖苷鍵構型，如果多糖分子中存在甘露糖苷，則一定有810 cm-1和870 cm-1的特征吸收峰，而且紅外光譜可以應用于定量分析取代型多糖，對于研究較難找到合適溶劑的取代型多糖的結構具有重要意義。
菊糖在1027 cm-1處出現一個較大吸收峰，這是由C-O伸縮振動υC-O引起，或者由一級醇的O-H變角振動引起，因此菊糖分子存在C-O-H和糖環C-O-C結構。1652 cm-1是糖分子中羰基C=O的伸縮振動吸收；935 cm-1是呋喃環的對稱伸縮振動吸收，871 cm-1是糖分子中次甲基CH2-的橫向振動吸收。
糖類存在分子間或者分子內氫鍵，O-H伸縮振動在3600-3200 cm-1出現寬峰。沒有氫鍵的二級O-H吸收峰在3630 cm-1附近，分子內氫鍵在3560 cm-1附近，分子間氫鍵在3400 cm-1以下。菊糖在3374 cm-1處出現一個寬峰，這是由O-H伸縮振動υO-H引起，說明分子結構存在分子間氫鍵。
羧甲基菊糖與菊粉的IR圖譜比較，除了多糖母體的特征吸收峰得以保留外，主要差別在1255 cm-1和819 cm-1處。菊粉在這兩處均無明顯吸收，經羧甲基改性后出現強吸收峰。其中1255 cm-1 C=O的伸縮振動，813 cm-1為糖環C-O-C的伸縮振動，這些是羧甲基的特征吸收峰。此外，3374 cm-1附近的羥基吸收峰有所降低，并且向高波數方向移動，表明部分羥基已被酯化，以上均表明多糖鏈中已引入羧甲基基團。
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