IgM的免疫活性也是多方面的。具體表現在以下幾個方面
抗傳染免疫作用
IgM是血管內主要的抗傳染性免疫物質。可通過激活補體系統發揮溶菌、溶細胞及中和病毒等免疫作用。由于IgM為五聚體結構，從理論上講，它和相應抗原的結合價應為10價，但往往可能由于空間位置的影響，只表現為5價。盡管如此，IgM還是有較多的結合價能與相應抗原多點結合，故其凝集作用及在補體參與下的溶血作用可較IgG強1000倍，是一種高效能的抗體。IgM缺乏的患者，易出現革蘭氏陰性菌引起的敗血癥或嚴重并發癥。但其在血清中的含量只有G的十分之一，在體內持續的時間也較短(為IgG的1/4)，且不能在血管外發揮作用，因此從總的來看，它還不能象IgG那樣起主力免疫的作用。
從生物的種系發生上看，IgM是最原始的抗體。在個體發育中，機體最先合成的抗體也是IgM，其后才相繼出現IgG與IgA。如兒童初次接種脊髓灰質炎疫苗后，于接種后3天血清中即出現lgM，兩周左右已達高峰，嗣后才逐漸下降，到2個月后血清中已不能測出。因此，在感染的早期，IgM起著先鋒免疫的作用。臨床上通過檢測IgM型抗體，可作為某些傳染病早期診斷及確定胚胎期感染的指標之gM的產生與抗原的性質有關。一般含脂多糖的顆粒性抗原，如對革蘭氏陰性菌的內毒素及紅細胞等產生的抗體即屬于IgM。但IgM型抗體的合成不需由T淋巴細胞輔助。
抗腫瘤免疫作用
在機體抗腫瘤免疫中，IgM起較重要的作用。IgM屬于一種細胞毒性抗體，在有補體系統的參與下，可破壞腫瘤細胞。