最近,中國科學技術大學單革教授實驗室在國際知名雜志《自然-結構和分子生物學》(Nature Structural & Molecular Biology)發表研究性論文,報導了其實驗室發現的一類新型非編碼RNA以及此類非編碼RNA的功能和功能機理。
非編碼RNA是一大類不編碼蛋白質而在細胞中起著調控作用的RNA分子。單革教授實驗室發現了一類新型的環狀非編碼RNA,在這類環狀RNA中,內含子沒有被除去、而是被保留在環形RNA當中,因此這類RNA被作者命名為外顯子-內含子環形RNA(EIciRNA)。該文研究了外顯子-內含子環形RNA的功能,發現此類非編碼RNA可以調控其自身所在的基因的表達。進一步的研究表明,外顯子-內含子環形RNA是通過招募U1小RNA蛋白復合物(U1 snRNP)來促進基因轉錄的起始。
環形RNA分子是最近數年才引起研究人員注意的,而此前的研究主要集中在線形RNA分子上。在此研究之前,報導的已知環形RNA分子都是由外顯子構成的,其中并不包含內含子序列。研究發現,外顯子-內含子環形RNA幾乎完全定位于細胞核中,這一點也與以前發現的其它完全由外顯子形成的環形RNA的細胞質定位不同。在此文當中,作者對為什么這些RNA會成為環形而不是線形分子也進行了研究,發現成環序列兩端經常會有互補的重復序列存在。此次發現外顯子-內含子環形RNA,以及對其功能和功能機理的研究,加深了對非編碼RNA種類和功能的認識。
文章的共同第一作者為李兆勇副教授以及博士生黃川和包純。研究得到了科技部、中科院、國家基金委,以及中國科大非編碼RNA功能及功能機理創新團隊的經費支持。
A,外顯子-內含子環形RNA(圖中紅色)定位于細胞核內(圖中藍色);B,外顯子-內含子環形RNA (EIciRNA)和RNA聚合酶II (Pol II)相互作用調控基因轉錄的分子機理示意圖。
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