中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所

　　計算生物學研究所成立于2005年10月，是中國科學院和德國馬普學會合作共建、聯合資助、共同管理的一個國際化研究機構。其建所宗旨是：致力于與實驗科學緊密結合的計算和理論生物學研究，補充完善上海生命科學研究院和馬普研究所的科研系統，傳播科學知識，培養造就人才，以簡潔優美的語言解讀生命玄機，為推動生命科學發展做出積極貢獻。

　　研究所依托上海生命科學研究院，在管理模式和運作機制方面借鑒了馬普學會所屬研究機構的有益經驗。研究所享有科學研究方面的完全自主權，其進行科學研究的主體是實驗室和青年科學家小組。實驗室主任和青年科學家小組組長由研究所的核心委員會在世界范圍內遴選產生，實驗室主任同時為研究所所長。由所長組成的所長委員會實施對研究所的日常管理，并對研究所理事會全面負責。同時，研究所的發展及所開展的科學研究工作受到來自世界范圍的科學家組成的專家委員會依據國際標準進行的持續質量監控，以保證研究所科研工作的質量和發展方向。

　　成立以來，研究所積極探索具有自身特點的發展模式，努力加強研究所的人才隊伍建設、學科方向建設、科研條件建設，大力推進國際合作，積極構建靈活高效的科學管理體系，已取得顯著成效。目前研究所已初具規模，基本架構已經形成，開始步入一個健康成長、快速發展的新階段。

　　在人才隊伍建設方面，研究所現已擁有來自9個國家包括科研、管理、支撐在內70余人的高素質人才隊伍，云集了一批世界范圍內從事計算生物學研究的優秀科研人才。目前，研究所已有4名實驗室主任(所長)、3名青年科學家小組組長和11名課題組長(PI)，他們共同組成了伙伴所的科研骨干隊伍，其成員全部為國外引進人才，其中外籍人數占到68%。在讀碩博連讀研究生39人，其中博士生12人，另有2名中外聯合培養博士生。在站博士后6人，其中4人為外籍。

　　在科研能力建設方面，研究所已建立了組合數學與幾何學、計算基因組學、調控基因組學、生物物理學4個實驗室以及比較生物學、蛋白質力學與進化、植物系統生物學3個青年科學家小組，圍繞數學在生物學中的應用形成了具有比較優勢的科研陣容和學科發展方向。

　　在科研產出方面，研究所的研究工作已取得積極進展，科研成果初見端倪。現已累計發表論文60篇，有50篇論文被SCI收錄，平均影響因子達到5.265，出版專著2部，承擔國家各類科技計劃項目9項。

　　在科研條件建設方面，研究所構建了Apple 和Linux兩套計算系統，計算生物集群系統規模已經擴大到200個運算節點,擁有1200個高性能CPU核，基本具備了處理海量生物信息的能力，初步形成了支撐計算生物學研究的條件平臺。同時，研究所整合所內資源，建立了用于輔助性“濕性”實驗和用作國外訪問學者客座研究的Uli Schwarz 實驗室。

　　在學術交流與合作方面，研究所先后與10多個國家的30多所大學、研究機構以及國內的數十家單位建立了緊密聯系，開展了實質性合作。已累計接待國際訪問學者160余人，應邀來所講學的諾貝爾獎獲得者3人，舉辦生物數學、結構生物學等10多期公開培訓課程，培訓國內外學生500多人次。

　　研究所成立來的發展實踐已受到了世界同行的熱切關注，在國際學術界產生了積極的影響，作為世界科學家從事計算生物學研究的國際平臺作用日益彰顯出來，在引領我國新興交叉學科發展中發揮了重要作用。

　　中國科學院上海生命科學研究院計算生物學研究所

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