動物所支持使用通用CO1基因片斷開展動物DNA條形碼研究

　　DNA條形碼研究的核心是采用某一基因片斷用于物種鑒別。在對動物的研究工作中，目前主要是采用線粒體細胞色素氧化酶1(CO1) 5’端約650bp左右的區域。但是該片斷的選用沒有充分的依據表明它的效力，并且有證據表明它不能很好的識別某些類群的物種。因此，中科院動物研究所科研人員基于真哺乳動物亞綱1179條線粒體基因組序列，對線粒體基因組中各蛋白質編碼基因，采用生物信息學方法評估其作為DNA條形碼的效力，期望在線粒體基因組范圍內尋找出最合適的基因片斷用作分子標記。

　　基于物種識別率，種內及種間變異，高級階元解決能力以及基因飽和度等四項標準，研究結果表明：目前通用的CO1 5’端可以反映各線粒體蛋白質編碼基因用于物種識別的效力；該片斷與其它基因相似，可以使物種識別率達到90%以上，且各基因片斷間在種內及種間變異上不存在顯著差異。不過，對于某些類群，各線粒體基因片斷依然存在種內與種間變異相重疊的問題；這些線粒體基因片斷對物種以上較高級分類階元水平的解決能力有限。

　　該研究整體上支持在線粒體基因組范圍內，首選現在通用的DNA條形碼，即CO1 5’端作為分子標記，用于至少是真哺乳動物亞綱的物種識別研究。

　　該研究主要由中國科學院動物研究所朱朝東博士課題組完成，論文發表于BMC Genomics（SCI影響因子3.67），第一作者為在讀博士生羅阿蓉。該論文目前成為該雜志亮點論文之一，鏈接為：http://www.biomedcentral.com/1471-2164/12/84。

　　該研究主要得到了中國科學院農業辦公室項目（KSCX2-YW-NF-02）、國家自然科學基金委項目（30870268, J0930004）、北京市自然科學基金委重點基金（6081002)資助，并部分得到中國農業部行業科技專項（200803006）、北京市自然科學基金委重點基金（KZ201010028028）等的資助。