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  • 發布時間:2016-05-26 15:13 原文鏈接: 林東昕院士NatureGenetics揭示抑癌lincRNA

      中國醫學科學院北京協和醫學院的研究人員在新研究中揭示,在基因間長鏈非編碼RNA (lincRNA) LINC00673中的一個胰腺癌風險變異為miR-1231構建了一個結合位點,干擾了PTPN11降解。這一重要的研究發現發布在5月23日的《自然遺傳學》(Nature Genetics)雜志上。

      中國醫學科學院的林東昕(Dongxin Lin)院士以及吳晨(Chen Wu)博士是這篇論文的共同通訊作者。林東昕院士的主要學術貢獻包括揭示并闡明我國食管癌、胰腺癌、肺癌等腫瘤的易感基因及基因-環境交互作用、遺傳變異對腫瘤放化療療效及預后的影響。已在Nature Genetics等期刊發表科學論文237篇。

      2007年,林東昕教授領導的一個研究項目確定出了一個與患癌癥風險相關的CASP8基因變異。這項研究的相關論文發表在Nature Genetics雜志上(林東昕小組《自然》子刊文章確定癌癥風險基因變異)。2014年8月,林東昕教授與新鄉醫學院的王立東教授以及美國國立衛生研究院的Philip R Taylor合作,針對3項中國人群食管鱗狀細胞癌(ESCC)全基因組關聯(GWAS)研究進行了聯合分析,結果發表在Nature Genetics雜志上。2014年9月,林東昕院士以及吳晨博士領導研究人員,通過基因組關聯研究鑒別出了中國人群喉鱗狀細胞(LSCC)的三個易感位點。相關論文再度發表在Nature Genetics雜志上。

      在過去的十年里,科學家們已發布了1300多項全基因組關聯研究(GWAS),發現了近6,500個與疾病或性狀相關的基因位點。然而,其中只有7%的位點定位在蛋白質編碼區域,而剩余的93%均定位在非編碼區域。蛋白質編碼區域的種系突變常常是極其有害或致命的,不可能讓攜帶者生存至癌癥發生;而調控區域的突變可以細胞類型或組織特異性方式造成基因表達的微小變化,有可能在攜帶者的預期生命期限內賦予了癌癥易感性。

      LincRNAs是一類長度大于200 nt的非編碼轉錄物,是人類非編碼轉錄組中最大的子類。越來越多的證據表明,lincRNAs參與了廣泛的細胞過程,包括調控表觀遺傳標記和基因表達,及胚胎干細胞多能性的維持及分化。與lincRNAs具有廣泛生物學作用相一致,一些研究表明包括癌癥在內的許多人類疾病與lincRNAs表達和功能異常有關聯。

      GWAS鑒別的許多位點都定位在lincRNAs編碼區域,表明lincRNAs遺傳變異有可能在癌癥等疾病的易感性方面起重要作用。因此,發現這樣的位點及闡明它們的生物學功能,對于認識癌癥的病因學,推動開發出篩查、預防和治療癌癥的新方法具有重要的意義。

      在這篇新文章中,研究人員采用全基因組關聯分析和功能分析,鑒別出了基因間長鏈非編碼RNA (lincRNA) LINC00673是一個潛在的腫瘤抑制子,它的種系變異與胰腺癌風險相關。LINC00673能夠增強PTPN11與E3泛素連接酶PRPF19之間的互作,通過泛素化作用促進PTPN11降解,減少SRC–ERK致癌信號,促進激活STAT1依賴性的抗腫瘤反應。LINC00673 4號外顯子rs11655237處發生G>A改變為miR-1231結合構建了一個靶位點,可以一種等位基因特異性方式減小LINC00673的影響,由此賦予對腫瘤形成的易感性。

      這些研究結果闡明了LINC00673在維持細胞穩態中所起的重要作用,以及它的種系變異賦予胰腺癌易感性的分子機制。

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