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  • 發布時間:2016-10-28 13:32 原文鏈接: 胎兒染色體非整倍體無創產前篩查:ACMG2016年更新共識

      2016年7月,ACMG(美國醫學遺傳學與基因組學學會)發表聲明,更新了關于胎兒染色體非整倍體無創產前篩查的共識(以下簡稱共識),該共識分述7個方面的內容,為方便閱讀和理解,我們對該共識的推薦意見進行了解讀并將按照原文的架構為您一一呈現。

      由于目前無創產前檢測臨床定位為篩查技術,故ACMG使用了NIPS(Noninvasive prenatal screening)而非NIPT(Noninvasive prenatal testing)這一統稱。無創產前篩查(NIPS)技術自2013年ACMG首次發表聲明以來,已快速整合進入產前檢查體系。新的研究證據建議對于不同年齡階段非肥胖的孕婦,在孕9-10周后可選擇NIPS來替代傳統的血清學篩查進行唐氏綜合征、愛德華氏綜合征和帕陶氏綜合征的篩查。但NIPS的檢測前咨詢至關重要,還需要討論三種目標染色體疾病以外的情況。因沒有其他的篩查方法可選擇,目前NIPS的應用已擴展到性染色體非整倍體和部分拷貝數變異(CNVs)的篩查。檢測提供者應對患者偏好有更加深入的了解,并幫助他們理解NIPS目前檢測的局限性。檢測實驗室應滿足檢測提供者及患者的要求,提供意義明確的檢測報告并幫助他們理解。

      一、NIPS臨床實踐:遺傳檢測涉及多層面臨床流程

      1、關于NIPS的遺傳咨詢,ACMG建議:

      1)應當為早孕期孕婦提供最新、適度且準確的信息,從而使患者不依賴所用的篩查方法,做出最佳選擇。

      2)檢測實驗室與公共衛生官員、政策制定者以及私人支付方共同合作,使所有孕婦都能夠接受到NIPS及其檢測前和檢測后的宣講與咨詢服務。

      2、關于檢測技術的選擇,ACMG建議:

      1)允許患者依據其個人目標與意愿,選擇診斷性或者篩查性技術,來檢測胎兒染色體非整倍體和/或基因組異常。

      2)應當告知所有孕婦,診斷性檢測(絨毛活檢或羊膜腔穿刺)是檢測染色體異常以及具有臨床意義的拷貝數變異(CNVs)的一種可供選擇的方法。

      二、NIPS是否應提供給所有患者,包括低風險或普通風險的孕婦?

      ACMG建議:

      1)應告知所有孕婦,對于傳統篩查技術的目標染色體非整倍體疾病(唐氏綜合征、愛德華氏綜合征、帕陶氏綜合征),NIPS是敏感性最高的篩查方法。

      2)當NIPS檢測報告提示胎兒染色體非整倍體高風險時,應推薦患者至專業遺傳醫師處咨詢。

      3)當NIPS篩查結果為陽性,應提供診斷性檢測。

      4)當胎兒診斷為染色體或者基因組變異時,應采用易懂的方式,為患者提供準確、無偏移及最新的信息,幫助胎兒父母理解他們所關注的問題。這些資料應當反映該疾病診斷蘊含的醫學與社會心理學意義。

      5)在檢測前宣傳資料和檢測報告中,檢測實驗室應當對篩查的目標疾病提供易懂且明確標識的DR、SPEC、PPV與NPV數據(分別為檢出率、特異性、陽性預測值、陰性預測值),以幫助患者和檢測提供方進行臨床決策與結果解讀。

      6)當檢測實驗室無法提供針對唐氏綜合征、愛德華氏綜合征與帕陶氏綜合征的DR、SPEC、PPV數據時,則不應開展針對這些疾病的篩查服務。

      三、NIPS是否應當用于篩查除21-三體、18-三體、13-三體之外的常染色體非整倍體?

      ACMG不推薦NIPS用于篩查21、18、13號染色體以外的常染色體非整倍體。

      四、NIPS檢測失敗(No-calls),應當如何避免、解讀與管理?

      1、胎兒DNA含量

      數據顯示如要得到可靠的NIPS檢測結果,胎兒DNA含量不能低于4%。如母體血漿中胎兒DNA含量不足則可能導致檢測失敗。

      ACMG建議:

      1)當在合適的孕周采血進行NIPS檢測,出現因胎兒DNA含量低導致檢測失敗的結果,此時應提供診斷性檢測,而不宜重復采血進行NIPS檢測。

      2)對于顯著肥胖孕婦,應提供傳統非整倍體篩查而不是NIPS。

      3)檢測實驗室應在NIPS檢測報告中明確提供胎兒DNA含量信息。

      4)檢測實驗室應建立針對胎兒DNA含量的分析方法并監測臨床檢測效度。

      5)檢測實驗室如出現NIPS檢測失敗的情況時,應在報告上注明原因。

      2、長片段純合序列

      基于SNP位點或微陣列技術進行基因組平衡性和拷貝數分析的檢測,需要母體和胎兒基因組具有充分的雜合性才能提供有意義的檢測數據。因此,長片段的純合序列會致使該區域的拷貝數變異無法檢測,包括小的重復或缺失。

      ACMG建議:

      1)應告知患者,基因組上大片段的純合序列可能導致檢測失敗(no-call),而這種情況可能是由于單親二倍體(UPD)或父母近親婚配所致。

      2)當患者疑似因UPD或父母近親婚配導致NIPS檢測失敗時,推薦患者至專業遺傳醫師處咨詢。

      3)當患者疑似因UPD或父母近親婚配導致NIPS檢測失敗時,應提供染色體微陣列分析(CMA)進行產前診斷。

      五、 NIPS是否應當用于篩查性染色體非整倍體?

      ACMG建議:

      1)作為NIPS檢測前咨詢內容,應告知所有孕婦NIPS應用擴展到性染色體非整倍體篩查的可行性。

      2)檢測者應努力制止缺乏臨床指征的患者單純出于胎兒生物學性別鑒定這一目的而選擇性染色體非整倍體篩查。

      3)將性染色體非整倍體作為檢測前咨詢的內容和篩查的目標疾病,應告知患者NIPS對于性染色體非整倍體篩查的假陽性率較高,并說明原因。在患者同意進行性染色體非整倍體篩查之前,還應告知患者,如胎兒確診為這類異常,預后可能存在較大差異(如特納綜合征)。

      4)當NIPS結果提示性染色體非整倍體高風險時,應推薦患者至專業遺傳醫師處咨詢。

      5)當NIPS篩查結果提示性染色體非整倍體陽性時,應提供產前診斷。

      6)當胎兒診斷為性染色體非整倍體異常時,應采用易懂的方式,為患者提供準確、適度及最新的信息,幫助胎兒父母理解他們所關注的問題。這些資料應當反映該疾病診斷蘊含的醫學與社會心理學意義。

      7)在檢測報告中,檢測實驗室應當對篩查的每一種目標性染色體非整倍體疾病提供易懂且明確標識的DR、SPEC、PPV與NPV數據(分別為檢出率、特異性、陽性預測值、陰性預測值),以幫助患者和檢測提供方進行臨床決策與結果解讀。

      8)當檢測實驗室無法提供篩查的目標性染色體非整倍體疾病的DR、SPEC、PPV和NPV數據時,則不應開展針對這些疾病的篩查服務。

      六、 NIPS是否應當用于檢測拷貝數變異(CNV)?

      ACMG建議:

      1、當滿足下述情況時,應當告知所有孕婦NIPS擴展至篩查有臨床意義的CNV的可行性:

      1)臨床醫生應當與患者就其選擇產前篩查還是診斷性檢測(絨毛活檢或羊膜腔穿刺術)的意愿進行討論。

      2)臨床醫生應當與患者就其通過產前篩查盡可能多的了解胎兒基因組信息的意愿進行討論。

      3)臨床醫生應當告知患者,與NIPS只檢測常見染色體非整倍體相比,NIPS針對CNV檢測的假陽性率與假陰性率更高。

      4)臨床醫生應當告知患者這些情況在確診后,其預后可能不確定。

      2、當NIPS發現CNV時,應推薦患者至專業遺傳醫師處咨詢。

      3、當NIPS發現CNV時,應提供CMA進行診斷性檢測(絨毛活檢或者羊膜腔穿刺)。

      4、當胎兒診斷為CNV時,應采用易懂的方式,為患者提供準確、適度及最新的信息,幫助胎兒父母理解他們所關注的問題。這些資料應當反映該疾病診斷蘊含的醫學與社會心理學意義。

      5、實驗室應當在檢測申請單與檢測前咨詢信息中,說明篩查的每一種CNV的DR、SPEC、PPV與NPV。這些資料應說明PPV與NPV是通過模型計算所得,還是臨床研究所得(即通過人群試驗或者已知發病率的樣本進行試驗所獲得的數據)。

      6、在檢測報告中,檢測實驗室應當對篩查的每一種CNV提供易懂且明確標識的DR、SPEC、PPV與NPV數據,協助患者和檢測提供方進行臨床決策與結果解讀。報告應說明PPV與NPV是通過模型計算所得,還是臨床研究所得(即通過人群試驗或者已知發病率的樣本進行試驗所獲得的數據)。當檢測實驗室無法提供篩查的目標CNV的DR、SPEC、PPV和NPV數據時,則不應開展針對這些疾病的篩查服務。

      ACMG不建議NIPS用于篩查全基因組范圍的CNVs。如果需要這一信息,推薦進行CMA診斷性檢測(絨毛活檢或羊膜腔穿刺)。

      七、特殊考慮

      1、對于多胎妊娠和/或供卵,ACMG建議:

      在多胎妊娠和/或供卵情況下,在提供NIPS作為篩查選擇前,應當聯系檢測實驗室了解這一情況下NIPS的檢測效度。

      2、對于NIPS檢測的非預期發現,ACMG建議:

      1)告知患者,NIPS檢測有可能發現母親的基因組非平衡性改變,這種可能性取決于所使用的方法。

      2)當NIPS發現母親基因組非平衡改變時,應推薦患者至專業遺傳醫師處咨詢。

      3)對具有從男性供者或生物學性別不確定的供者處接受過骨髓或器官移植病史的患者,應提供NIPS以外的其他非整倍體篩查檢測。

      4)如果孕婦在NIPS采血前的4周內接受過輸血治療,應就NIPS提示的性別與胎兒真實的生物學性別不一致的可能性進行討論。

      3、對于陽性預測值與陰性預測值,ACMG建議:

      1)檢測實驗室在報告陽性檢測結果時,提供受檢者的PPV。

      2)檢測實驗室在報告陽性檢測結果時,如因未獲得臨床信息而無法提供受檢者的PPV,可提供群體PPV。

      3)檢測實驗室在報告陽性檢測結果時,如果無法提供受檢者PPV與群體PPV時,可提供模擬的PPV值。

      4)當NIPS結果為陽性時,檢測方應使用經過驗證的在線計算工具提供受檢者PPV,從而幫助其與患者進行清晰準確的交流。

      5)當使用在線計算工具時,應結合實驗室自身的DR和SPEC值,為患者提供清晰及個體化的信息。

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