木材的形成是一個復雜的發展過程,主要由轉錄網絡調控。microRNA (miRNA)通過mRNA降解和翻譯抑制,調節植物生長發育過程中靶基因的表達。
這項研究中,中國林業科學院盧孟柱課題組使用小RNA測序和降解組測序技術,研究不同剝皮時間后,毛白楊miRNAs參與SVS再生的表達情況。實驗中取材四年生毛白楊樹干,環狀剝皮后7, 10, 12, 16, 18,和21天的再生組織。
小RNA測序結果表明,在再生組織中共發現209個已知miRNAs,187個新miRNAs。
降解組測序分析發現,157個靶基因由21個已知miRNAs控制,75個靶基因由30個新miRNAs調控。
GO分析結果表明,15個miRNAs的靶基因在生長素信號通路、細胞分化,分生組織發育中富集表達。
次生維管系統再生主要包括維管形成層啟動,形成和分化階段的連續過程。
本研究為miRNAs在SVS再生調控方面發揮的作用提供了理論依據。
本研究中降解組測序由聯川生物協助完成。
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