胃癌是世界第四大癌癥,在所有癌癥致死率排行中名列第二。每年都有超過一百萬的病人被確診為胃癌,其中 75%來自亞洲。常見的胃癌相關生物標志物有癌胚抗原(carcinoembryonic antigen)和糖類抗原19-9(carbohydrate antigen 19-9),但這些生物標志物對于早期胃癌診斷的靈敏度和特異性都不高。由于缺乏明顯的癥狀及早期診斷方法,胃癌患者通常在晚期被確診,而此時的平均生存率只有7-9個月。因此,發現新的高靈敏度早期胃癌生物標志物相當重要。
microRNA是一類小分子非編碼RNA,在調控基因表達方面發揮著重要作用。最近有研究表明,不同的腫瘤顯示出特異性的microRNA表達譜,腫瘤來源的microRNA能被釋放到循環系統中,進入血液組織。而在血液組織中,microRNA能避免被 RNase降解,具有良好的穩定性。因此,血清血漿中的microRNA有成為腫瘤生物標志物的潛力。例如,最近的研究發現在彌漫性大B細胞淋巴瘤患者的血清中miR-21的含量比正常人群高。
在本文中,研究人員利用Agilent microRNA芯片,比較了胃癌患者與正常個體血清的microRNA表達譜,發現胃癌患者血清中,miR-378表達量高于正常人群。miR-378可以做為胃癌早期診斷的標志物。這一成果對于胃癌的早期診斷具有重要意義。相關microRNA芯片技術服務由上海伯豪生物技術有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心完成。
科學家們首先收集了7個胃癌患者、7個結腸癌患者和10個正常個體的血清樣品,用Agilent公司的microRNA芯片進行microRNA表達譜分析,并對芯片結果進行RT-PCR驗證。結果得到了7個在胃癌患者血清中高表達的microRNA。
隨后用qRT-PCR的方法在另外收集的樣品中對這7個microRNA進行進一步驗證。使用U6 snRNA作為標準化內參,檢測這7種microRNA的表達量,發現miR-187*,miR-371-5p,miR-378這三個microRNA在胃癌患者血清中特異性高表達。
隨后,科學家們在大量樣品中檢測這三種microRNA診斷胃癌的能力,發現miR-378作為生物標志物的診斷價值最高,靈敏度達87.5%,特異性達70.73%,而增加另外兩種microRNA聯合診斷,并不能提高診斷價值。對比胃癌TNM分期不同病期樣本血清中miR-378的表達量,發現miR-378在胃癌早期就有明顯的表達上調,且與正常樣本相比差別有顯著意義。
綜上所述,科學家們利用microRNA芯片發現miR-378在胃癌患者的血清中高表達,且在胃癌早期就有明顯的表達上調。MiR-378作為生物標志物對胃癌進行診斷,靈敏度可達87.5%,特異性達70.73%。這一研究成果對于胃癌的早期診斷有重要意義。
原文:Hanshao Liu, Lin Zhu, Bingya Liu, Liu Yang, Xianxin Meng, Wei Zhang, Yueyun Ma, Huasheng Xiao. Genome-wide microRNA profiles identify miR-378 as a serum biomarker for early detection of gastric cancer. Cancer Letters. 2 November 2011(影響因子4.86)
上海伯豪生物技術有限公司(簡稱SBC)是上海生物芯片有限公司/生物芯片上海國家工程研究中心旗下致力于研發外包服務的控股子公司。公司不僅是Affymetrix公司在中國第?一家認證的服務提供商,同時也是Agilent公司和ABI公司在國內認證的服務提供商。目前擁有五大微陣列芯片服務平臺(SBC、Affymetrix、Agilent、NimbleGen和Illumina芯片平臺),三大第二代測序服務平臺(ABI SOLiD5500、Illumina Solexa、和Roche454測序平臺)以及ABI定量PCR、ABI 3730測序等驗證服務平臺。正在為國內外廣大客戶提供優質而穩定的服務。
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