序列變異的周期性和與TCR相關聯的突變
基因突變會導致人類疾病的產生,因此研究遺傳變異的產生過程和那些能夠引起疾病的突變對生命科學基礎研究以及人類健康是十分關鍵和重要的。
近日,中國科學院北京基因組研究所于軍研究員帶領其研究團隊,在有關人類基因組中以轉錄為中心的突變研究方面取得新進展。相關研究成果在Genomics, Proteomics & Bioinformatics雜志上發表。
該研究組崔鵬博士等人通過對人類10種不同組織的高通量RNA測序數據和SNP(單核苷酸多態性)數據進行分析,研究了人類基因組的轉錄突變過程,對人類基因突變的基本法則提出了新的見解。研究結果顯示,人類基因組中基因突變率與它們的表達水平成正相關。這說明突變并不是隨機產生的,而更傾向于在那些表達頻率更高和表達量更高的基因中產生并累積。
此外,他們通過研究12種類型的核苷酸突變頻率,發現C→T,A→G,C→G,和G→T是人類基因組的四種主要轉錄突變類型。同時,研究也表明,突變修復率從轉錄本的5′端到3′端呈下降趨勢,并且下降幅度與基因表達水平相關,這可能與轉錄偶聯的DNA分子修復過程(Transcription-coupled DNA Repair,TCR)有關。最后,研究還提出人類基因組遺傳變異的周期性應該是核小體定位和TCR作用的共同結果。
該研究表明,人類基因組以轉錄為中心的突變是基因和基因組進化的主要驅動力之一,為人類基因突變研究提供了新的思路。
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