色譜基線也常被稱作背景噪音，是在無樣品組分通過色譜檢測器時，檢測器響應信號的隨機分布。基線噪音的大小直接影響色譜分析方法的檢測靈敏度以及對雜質的檢出能力，如純度測試以及痕量物質殘留檢測方法等。
對于液相色譜而言，等度洗脫模式下，由于流動相的組成保持一致，其折光率不變，因而基線比較平坦，噪音比較小。但該模式的雜質檢測能力一般且方法運行時間比較長，不適合于多組分或基質復雜樣品的分析；梯度洗脫模式下，基線隨流動相組成的變化而不斷變化，基線噪音比較大，但其具有明顯縮短分析時間以及增加雜質的檢出能力(梯度洗脫時，色譜峰被梯度變化的流動相縱向壓縮，從而其峰寬減小，峰高增加)的特點，使其日益成為最為常見的液相色譜操作方式。
正常的基線噪音一般具有連續變化的特點，如下圖1A所示；基線噪音的測試可按照下圖1B所示方法進行。