該儀器可廣泛用于基因測定，癌細胞的表達普測定、親子鑒定、個體識別、基因檔案、父系鑒定、母系鑒定、種族鑒定、種屬鑒定、傳染病毒的測定及胎兒遺傳缺陷的分析，比如癌細胞有起固有的表達方式，通過測定可得知人體癌細胞的發生和變化情況。另外，國產第三代基因測序儀的研發將極大地拓寬生命科學、生物化學、生物醫藥等領域，廣泛地應用臨床醫學、生物能源等。
