根據《福建省教育廳辦公室關于做好高校“2011協同創新中心”績效評估工作的通知》（閩教科〔2017〕9號），在現場答辯、專家評審的基礎上，經研究，確定第一批15個省級“2011協同創新中心”終期績效評估結果（10個優秀、5個良好）；第二批19個省級“2011協同創新中心”中期績效評估結果（5個優秀、3個良好、10個合格、1個有條件合格）。以下是公示結果：
第一批15個省級“2011協同創新中心”終期績效評估結果
| 序號 | 中心名稱 | 牽頭高校 | 結果 |
| 1 | 醫用生物制品協同創新中心 | 廈門大學 | 優秀 |
| 2 | 海洋生物資源開發利用協同創新中心 | 廈門大學 | 優秀 |
| 3 | 石材產業加工技術與裝備協同創新中心 | 華僑大學 | 優秀 |
| 4 | 海西環境與能源光催化協同創新中心 | 福州大學 | 優秀 |
| 5 | 海峽兩岸文化發展協同創新中心 | 福建師范大學 | 優秀 |
| 6 | 菌草生態產業協同創新中心 | 福建農林大學 | 優秀 |
| 7 | 干細胞轉化醫學協同創新中心 | 福建醫科大學 | 優秀 |
| 8 | 康復技術協同創新中心 | 福建中醫藥大學 | 優秀 |
| 9 | 南音文化傳承與發展協同創新中心 | 泉州師范學院 | 優秀 |
| 10 | 福建省環保節能型高性能混凝土協同創新中心 | 福建江夏學院 | 優秀 |
| 11 | 能源經濟與能源政策協同創新中心 | 廈門大學 | 良好 |
| 12 | 海西新型顯示器件與集成協同創新中心 | 福州大學 | 良好 |
| 13 | 福建省高端裝備制造協同創新中心 | 福州大學 | 良好 |
| 14 | 海西綠色生物制造技術協同創新中心 | 福建師范大學 | 良好 |
| 15 | 海峽兩岸特色作物安全生產協同創新中心 | 福建農林大學 |
良好 |
第二批19個省級“2011協同創新中心”中期績效評估結果
| 序號 | 中心名稱 | 牽頭高校 | 結果 |
| 1 | 半導體光電材料及其高效轉換器件協同創新中心 | 廈門大學 | 優秀 |
| 2 | 海西政務大數據應用協同創新中心 | 福州大學 | 優秀 |
| 3 | 醫學光電信息技術協同創新中心 | 福建師范大學 | 優秀 |
| 4 | 中醫健康管理協同創新中心 | 福建中醫藥大學 | 優秀 |
| 5 | 客車及特種車輛協同創新中心 | 廈門理工學院 | 優秀 |
| 6 | 水環境健康與安全協同創新中心 | 廈門大學 | 良好 |
| 7 | 海峽兩岸紅壤區水土保持協同創新中心 | 福建農林大學 | 良好 |
| 8 | 中國烏龍茶產業協同創新中心 | 武夷學院 | 良好 |
| 9 | 海西衛星導航定位技術協同創新中心 | 廈門大學 | 合格 |
| 10 | 海外華文教育與中華文化傳播協同創新中心 | 華僑大學 | 合格 |
| 11 | 海西食品安全檢測技術與產品協同創新中心 | 福州大學 | 合格 |
| 12 | 閩臺特色作物種質創制與綠色栽培協同創新中心 | 福建農林大學 | 合格 |
| 13 | 海西免疫治療產學研協同創新中心 | 福建醫科大學 | 合格 |
| 14 | 福建游艇產業共性關鍵技術協同創新中心 | 集美大學 | 合格 |
| 15 | 區域農村教師發展協同創新中心 | 閩南師范大學 | 合格 |
| 16 | 北斗導航與智慧交通協同創新中心 | 福建工程學院 | 合格 |
| 17 | 媽祖文化傳承與發展協同創新中心 | 莆田學院 | 合格 |
| 18 | 綠色鑄鍛及其高端零部件制造協同創新中心 | 三明學院 | 合格 |
| 19 | 公共政策與地方治理協同創新中心 | 廈門大學 |
有條件合格 |
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