騏驥聯手Waters發布QiMetA軟件為組學提供場景化分析利器

　　分析測試百科網訊 2018年9月9日，由北京騏驥生物技術有限公司和沃特世科技有限公司主辦的Qi MetA軟件全球發布會在北京舉辦。來自臨床、科研和投資等多領域的50余人參加了此次活動。

活動現場

主持人：北京騏驥生物技術有限公司 徐麗麗

北京騏驥生物技術有限公司董事長 王文軍

　　北京騏驥生物技術有限公司董事長王文軍在致辭中表示多年前在工作中遇到了很多問題，沒有一款產品能夠解決。在3年前騏驥生物與沃特世建立了良好的合作關系，在代謝組學方面拓展工作。今天終于發布了這款Qi MetA軟件，Qi MetA軟件能夠提供一站式數據分析，一步法數據前處理方案，常用統計分析全覆蓋，提供貼合場景的可視化方案。騏驥生物已經成立5年多了，這5年多，從科研服務走到臨床服務，目前已建立兩所醫療診斷所。未來騏驥生物還將在這方面做更多的拓展性工作，讓軟件增加更多的功能，更深入、更廣泛的挖掘數據之間的價值，鏈接數據與業務之間的關系，讓我們的數據真正的服務于人類的健康！

沃特世科技有限公司臨床市場部高級經理 譚曉杰

　　沃特世科技有限公司臨床市場部高級經理譚曉杰表示沃特世與騏驥已經是多年的老朋友了，不僅積累了友誼，也積累了大量合作和實戰的經驗。現在，健康中國2030是整個國家的主題，隨著逐漸進入老齡化社會，糖尿病等慢性病人群已達到1.17億，60歲以上人口達2.7億，大病、慢病給家庭成員的健康帶來了威脅和挑戰。沃特世一直致力于色譜和質譜的研究，在軟件方面也有投入，單一指標對于疾病的描述是遠遠不夠的，在液質聯用領域，一個樣品能夠生成幾萬個數據，解析幾萬個數據又變的很復雜。與騏驥生物的合作過程中，大數據的處理能力在這個新的軟件上又進一步得到了提升，這個產品的特點在原有的基礎上更加貼近本地化的場景，相信這個軟件在未來不斷迭代的過程中，一定會更精準的治療，而且可視化程度更強，給出非常漂亮的答卷。

遠毅資本副總裁 宋依然

　　遠毅資本副總裁宋依然介紹到遠毅資本是一家國際風險投資基金，專注于投資醫療健康和創新金融技術領域的早期和成長期企業。公司從去年年底開始接觸到騏驥生物公司，到今年完成了投資，騏驥生物在技術方面做的十分扎實，在生物分析方面有著獨到的見解和經驗。希望通過這次合作，真正的幫助用戶解決臨床的問題，最終，服務于人類的健康！

北京騏驥生物技術有限公司 陳顯揚博士

　　北京騏驥生物技術有限公司陳顯揚博士對新產品——Qi MetA軟件進行介紹。

　　隨著多層次的組學包括代謝組學的研究展開，高通量的數據收集已經可以實現，但是與其他的組學學科相似，代謝組學的數據分析仍是難題，尤其是數據到底意味著什么。因此數據的挖掘以及場景化分析，已經成為各領域學者和用戶面對生物學研究，特別是代謝組學研究的最大瓶頸。

　　具體的來看有以下幾個問題：

　　1）數據的合并，包括多維多層次數據的整合：高噪聲，高變異，冗余性。以代謝組學為例，當峰值檢出（peak picking）和峰值鑒定（peak identification）后，如何將這些數據有效的進行清洗，篩選，組合，并快速的進入場景化分析，成為了組學初學者的攔路虎。

　　2）快速掌握數據特征：高維，分布不規則。生物學數據除了維度外，還帶著意義，所以面對高通量的數據，如何下手，快速掌握整體數據的特征成為數據深度挖掘前的又一大問題。例如，篩選海量參數的離群值，均值，方差，每個設定組別的正態分布，方差齊性，p值，FDR，以及回歸R2等等。

　　3）特征向量篩選：小樣本大數據，關系復雜，多變量分析。對于大數據的分析和挖掘，都屬于“收口”式研究，不能只掌握了數據特征而得不到數據的結論。無論數據多么“大”，最終都要找出特征向量或者分子標志物。這個是核心的問題，涉及的內容也非常復雜，從簡單的差異比較，到相關性網絡分析，到模型的降維，參數重要性分析等等。

　　4）場景化應用：標志物和模型優化。不同研究背景的人，拿到數據可能會得到不同的分析結果，這是由于大家應用場景的不同。如何將分析和挖掘后的數據結果，進行場景化的應用，這個形成了數據分析挖掘落地的最后一個問題。

　　基因測序以及質譜分析作為能解釋“這是什么”的兩大工具已經深入到科學研究，特別是生物學研究的各個領域。沃特世公司（沃特世公司紐約證券交易所代碼：WAT），專注于為實驗室相關機構開發和生產先進的分析和材料科學技術。50多年來，公司開發出一系列分離科學、實驗室信息管理、質譜分析和熱分析技術。沃特世為高通量數據提供創造工具，同時也致力于推動數據分析和挖掘手段的不斷更新和進步。

　　騏驥公司的數據團隊貼近質譜應用場景，研究質譜用戶的使用邏輯，開發出了Qi MetA數據分析軟件，不僅符合生物學分析人員的需求，也無縫對接沃特世的代謝組學工作，形成一站式分析平臺。通過這次的合作，騏驥未來將攜手沃特世服務全球更多的用戶，并推動質譜數據分析更高效，更準確，更便捷。

　　具體的說，Qi MetA軟件解決了代謝組學中幾大棘手的問題：

　　1）一站式數據合并。解決代謝組學數據的高噪聲，高變異，冗余性。

　　2）一鍵式的統計學分析，解決了復雜的統計學專業性問題。不僅針對代謝組學，同時可以應用于所有生物學分析，一鍵獲得正態分布，方差齊性，T檢驗，秩和檢驗等等一系列統計學分析結果。

　　3）完整的針對組學探索性分析，解決了數據高緯度，關系復雜問題。快速掌握各維度下，數據分布規則，相互關系，多變量間的相關網絡以及重要性。

　　4）針對特征變量的篩選以及場景化應用的模型。提供多種模型用于建設，并且具有多模型比較的交互式應用，解決代謝標志物應用的問題。

　　Qi MetA是一個視窗化的數據處理和分析軟件, 應用于代謝組學和臨床數據的分析，但功能也可以擴展到生物學數據分析和可視化的多個方面。適合于一站式代謝組學分析、臨床數據分析分析，以及單獨的生物學項目分析。它獨有的特點和功能主要包括：

　　首先，可以直接應用沃特世公司Progenesis QI軟件導出的數據，直接進行處理，獲得可供分析的標準化數據；自動進行以QC為標準的數據篩選，包括0值篩選，CV篩選和LOESS回歸。并自動提供QC的PCA以及樣本+QC的PCA分布；

　　其次，軟件不僅可以獲得單因素下兩組數據差異分析所有統計學指標，更可以進行n組的比較，得到整組的p值以及組間的p值；

　　第三，Qi MetA針對單變量進行回歸分析，同時可以批量針對所有變量進行R2篩選；使用HMDB和Lipidmaps全庫，對鑒定的化合物進行分類和比例變化分析；

　　第四，軟件提供單/多組（偏）最小二乘法判別分析(O)PLS-DA的快速切換；(O)PLS-DA 提供permutation結果以及cross-validation功能；通過Vip、p value、fold、fdr參數閾值設定，一步法獲得潛在生物標志物；

　　第五，在軟件中，可以自動或者手動快速建立：邏輯回歸（logical regression），決策樹（decision tree）,隨機森林（random forest），Bagging，支持向量機（support vector machine）以及GBM（gradient boosting machine）模型；自動或者手動給出以上各種模型的ROC曲線以及模型評價參數；對潛在的生物標志物組合提供7種可選模型，并同時可以進行4種模型ROC和評價；

　　第六，Qi MetA針對不同場景，不僅可處理代謝組學和脂質組學等組學數據，同時也可以處理臨床數據和其他生物學數據；每次分析按照項目分類，歷史記錄查詢以及斷點工作繼續非常方便；瀏覽、處理、瀏覽、處理 …… 透明化的流程使結果更加可信。

　　Qi MetA軟件的發布，是騏驥數據分析和利用工作的第一步，也是騏驥和沃特世共同探索和挖掘數據價值的開始。未來，騏驥會在Qi MetA的數據分析平臺上，開發更多的場景化應用，形成醫療軟件，更深入探究數據價值，提供更有效的數據解決方案，包括：

　　第一，數據前處理的功能拓展，包括特征峰的準確鑒定（peak identification），個性化數據庫的建立，數據的批量提取，數據的標準化等。

　　第二，生物學功能的深入闡述。未來軟件不僅給出數據分析的結果，還最大程度的將其生物學意義進行闡述，讓用戶更便捷的掌握數據后面的科學意義。

　　第三，展開生物知識圖譜的研究。提供目標代謝物或者目標分子的相關信息擴展功能，當用戶通過一系列篩選得到目標化合物后，可以快速得到與該化合物相關的完整信息，有助于其下一步研究和應用的快速推進。

　　更多關于Qi MetA軟件介紹：http://www.qijibio.com/qi-meta/

　　在這成熟的金秋，騏驥生物收獲了豐碩的果實--Qi MetA軟件。Qi MetA作為一款個性化的數據分析和挖掘軟件，得到了沃特世公司的鼎力支持，以及同行，專家，學者的幫助，大家的認可和鼓勵，也給我們繼續向前的信心。通過這個數據平臺，我們未來有信心提高代謝病分析水平，更有效地進行疾病的早期檢測與臨床診斷，最終成為精準醫療和智能診斷的開拓者和先驅者。

問答環節

　　中國中醫科學院中藥研究所徐江博士、沃特世科技有限公司生命科學研究市場部高級經理賈偉、沃特世科技有限公司臨床市場部高級經理譚曉杰、清華大學第一附屬醫院主任醫師李非、分析測試百科網總經理卞利萍和京東醫療云部門馬睿澤等紛紛對軟件的適用性、應用領域等與陳顯揚博士和王文軍董事長進行了探討。

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