現代研發的凝膠成像儀與以往大體積的凝膠成像儀不同，它擁有小巧精致的外觀，完全顛覆了人們的詳細，而且凝膠成像儀所具備的優越性能在很大程度上提高了實驗的效率。但是作為應用于實驗中的儀器設備，在經過了長時間的使用之后，要說一點問題都沒有是不太可能的，凝膠成像儀在使用的過程中也會存在一些硬件方面的問題和軟件方面的問題，這里主要介紹一下凝膠成像儀常見的硬件問題有哪些？
1. 紫外透射燈箱無法正常使用
當使用凝膠圖像系統時，透射紫外無法開啟，請檢查暗箱推門是否合緊，電源開關是否打開；若開啟后燈不亮，請切斷電源，檢查紫外透射燈箱后方的電源連接線是否松動，該儀器的保險絲是否燒毀。
2. 機箱面板失靈
判斷計算機控制是否正常。
3. 反射白光燈無法正常使用
判斷計算機控制是否正常，暗箱板面按鍵是否正常；檢查暗箱內反射白燈的連接線是否松動。
4. 電腦無法正常使用
判斷是否其他軟件能正常使用；若電腦問題請與生產企業聯系。判斷GIS暗箱能否單獨正常使用； 若電腦正常，則需檢查RS232通訊線是否正確連接，軟件是否受到病毒分割；若判斷是電腦軟件的問題，建議重裝Windows操作系統后，再安裝GIS軟件。
5. 暗箱抽屜無法合緊
抽屜軌道上的橡皮圈磨損。
6. 拍攝視野中有黑色斑點或視野無法調清晰
鏡頭上有灰；濾光片發霉。
7. 聚集平臺無法正常使用
打開暗箱電源時，系統會出現二聲報警音；當使用凝膠圖像系統時，聚集平臺無法升降，請檢查系統是否提示聚集平臺不能正常復位（回到最低位置）；請切斷電源檢查平臺底部是否有異物，去除異物后重新啟動，平臺有輕微聲響。
8. 自動濾光片輪無法正常使用
打開暗箱電源時，系統會出現三聲報警音；開啟凝膠圖像時觀察自動濾光片輪是否有自檢過程，該過程有輕微響聲；檢查儀器背面自動濾光片輪的連接線是否松動；判斷計算機控制是否正常。