根據不同試驗的需要，電泳槽的種類也不相同，其可以分為水平電泳槽、垂直電泳槽和轉移電泳槽這三類。而就垂直電泳槽而言，其也有不同的型號。
垂直電泳槽一般來說主要是用于對少量核酸及蛋白質樣品進行垂直電泳，主要是蛋白樣品的電泳，在進行種子的有些試驗中會用到。垂直電泳槽從特點上來看，其中間是夾在一起的兩塊玻璃板，玻璃板兩邊由墊條隔開，在玻璃平板中間制備電泳凝膠，凝膠的大小通常是12cm～14 cm，厚度1mm～2 mm，近年來新研制的電泳槽，膠面更小、更薄，以節省試劑和縮短電泳時間。制膠時在凝膠溶液中放一個塑料梳子，在膠聚合后移去，形成上樣品的凹槽。
從垂直電泳槽的型號上來進行劃分的話，垂直電泳槽可以分為小型、中型和大型這三類。而進行區分的點在于凝膠板規格大小和試樣格齒數及厚度。因此在進行試驗的時候，應該根據試驗的需要進行選擇相應規格的垂直電泳槽，保證試驗的順利進行。
從垂直電泳槽的原理上來看，它與圓盤電泳槽基本相同。當然也有差別，比如垂直電泳槽制膠和電泳不在電泳管中，而是在塊垂直放置的平行玻璃板中間。企業在選購垂直電泳槽的時候，要記得加以區分。