名稱:志賀氏菌屬,熒光定量,PCR檢測試劑盒
實驗操作步驟
1. DNA提取:取增菌液1mL加到1.5mL無菌離心管中,10,000rpm離心5min,棄去上清;加入50μL DNA提取液,充分混勻后沸水浴5 min,13,000rpm離心5min,取上清液進行檢測或保存于-20℃以待檢測。
2. 擴增試劑準備(在試劑貯存和準備區完成)
2.1. 從試劑盒中取出PCR反應液,冰盒上融化后混勻。試劑在使用前2000rpm離心20s備用。
2.2. 設需要的PCR反應管管數為N(N = 待檢樣本數+ 1管陰性對照 +1管陽性對照)。
2.3. 混合液的配制:首先吸取體積為22.6(μL)×N反應液至1.5mL滅菌離心管,再加入Taq DNA聚合酶0.4 (μL)×N,混勻后2000rpm離心20s,然后向N 個0.2mL PCR反應管中分裝已加入Taq酶的混合液23μL/每管,蓋緊管蓋。
2.4. 注意:陰性對照管建議在此區中加入2μL陰性對照樣品。
3. 加樣(在樣品制備區完成)
3.1. 陽性對照取出解凍,使用前2000rpm 離心20s。
3.2. 將保存在-20℃的核酸提取物置室溫解凍,以13,000rpm離心5min;向N個PCR管中分別加入待檢樣本DNA(包括陽性對照)2μL,蓋緊管蓋,2000rpm離心20s,將PCR反應管轉移至核酸擴增區。注意做好樣品號標記。
4. PCR擴增(在核酸擴增區完成)
4.1. 上機前應檢查各反應管是否蓋緊。
4.2. 反應體系設為25μL;熒光信號采集設定在退火溫度。對于多通道熒光PCR儀,選擇熒光素FAM為信號采集通道。
4.3. PCR循環參數為:*階段,95℃ 3 min預變性;
第二階段,[95℃ 10s;60℃ 40s] × 40次循環。
注意:在Roche的LightCycler上使用,變性溫度95℃改為93℃,其他不變。
5. 質量控制標準及結果判斷
5.1 綜合分析儀器給出的各項數據及擴增曲線,設定合理的閾值(Threshold)和基線(Baseline),使儀器給出正確的結果。
5.2 陰性對照CT值應顯示為0或≥40.0,陽性對照的CT值應≤30.0,否則視實驗失敗,需重做。
5.3 檢測樣品CT≤35.0,結果有效,可直接報告樣品陽性。
5.4 檢測樣品35.0
5.5 檢測樣品CT值為零,報告樣本陰性。
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