實驗方法原理 | 如果將微生物細胞裂解,使其擬核(即染色體 DNA)被抽提出來,通過溴化乙淀(ethidium bromide,簡稱 EB)染色并進行瓊脂糖凝膠電泳,便可觀察到釋放到細胞外的染色體 DNA。EB 是一種扁平分子染料。可特異性插入 DNA 堿基對之間,在紫外線照射下,使 DNA 呈現熒光,因而可觀察到凝膠中的染色體 DNA,由于在提取過程中大分子染色體 DNA 的隨機斷裂,所以經凝膠電泳后形成的是一條不整齊的濃的熒光帶。 用 EB 染色法進行的體外觀察染色體 DNA 也分兩步進行: 1. 將細胞裂解后抽提染色體 DNA; 2. 通過含有 EB 的瓊脂糖凝膠電泳在紫外光下觀察染色體 DNA 熒光帶。 |
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實驗材料 | |
試劑、試劑盒 | TE 緩沖液10% SDS蛋白酶 K(20 mg ml)5 mol L NaClCTAB NaCI酚 氯仿 異戊酵(25:24:1)異丙酵70% 乙醇溴酚藍加樣緩沖液TAE 電泳緩沖液 |
儀器、耗材 | |
實驗步驟 | 1. 取 4.5 ml 大腸桿菌過夜培養液于 5 ml 塑料離心管中,12000 r/min 離心 1~2 min,棄上清。 2. 將細胞沉淀懸浮于 1.7 ml TE 緩沖液中,加入 10% SDS 90 μl 和 20 mg/ml 的蛋白酶 K 9 μl 混勻,37℃ 保濕 1 h。 3. 加入 5 mol/L NaCl 300 μl,充分混勻,再加入 240 μl CTAB/NaCl,混勻,置 65℃ 水浴 10 min。 4. 加入等體積的酚/氯仿/異戊醇(25:24:1)混勻,12000 r/min 離心 5 min。 5. 將上清水相轉入另一潔凈的塑料離心管中,加 0.6 倍體積的異丙醇使 DNA 沉淀下來。 6. 快速離心數秒鐘,棄上清,用 70% 的乙醇淋洗 DNA 2 次,將 DNA 沉淀經真空干燥后溶于 300 μl TE 緩沖液中。 用此法獲得的染色體 DNA 可用于限制性酶切等分子生物學操作。 7. 取少量(約 3~5 μl)提取的 DNA 樣品(其余置于-20℃ 保存),加入 3 μl 溴酚藍加樣緩沖液,混勻后上樣進行瓊脂糖凝膠電泳 1 ~ 2 h。瓊脂糖中加有 EB,在電泳過程中,EB 將插入 DNA 分子中。 8. 戴上一次性塑料手套(EB 是強誘變劑)將凝膠取出置于紫外分析儀上觀察染色體 DNA 熒光帶。 |
注意事項 | 必須通過一塊普通玻璃或戴上防護眼鏡進行現察,以免損傷眼晴。 |