This page should point you to the many different general and lab-specific protocols describing tissue and cell lysis and serve as forum for comparison. The ups and downs of various methods from sonication, homogenization, freeze-thaw cycles, and detergent-based lysis are examined below.
most efficient method of cell fractionation
problem: heat build up which can denature proteins (proportionate to length of sonication)
precaution: do on ice and sonicate intermittantly
material: ultrasonication bath or rods
best for animal tissue; less suitable for cells
precaution: do on ice to reduce heat build-up and denaturation
material: drills (polytron), pestle/tube (dounce) bead beaters
least effective method
plus: does not denature proteins as much as other methods
material: pestle and mortar, liquid nitrogen
chemical method of lysis
problems: detergent may inhibit subsequent reactions
problems: detergent may disrupts protein interactions
no additional material required, just the chemicals and typical tubes
description/link | target | lysis method | type of material |
---|---|---|---|
Silver: Lysate for Western | protein | detergent (Triton) | cells |
Sauer:Lysing E. coli with Lysozymes | lysozyme | bacteria | |
Blackburn:Yeast Colony PCR | DNA | NaOH | yeast |
Jacobs:Protocol Total Protein Isolation Using RIPA Lysis Buffer | protein | detergent (RIPA buffer) | cells |
Streptomyces:Protocols/Mini-Maxi Prep | DNA | NaOH | bacteria |
Western Blot/Tissue Preparation | protein | detergent & physical disruption | tissue |
Eccles:Protein Lysates from Cells in Culture | protein | detergent (SDS, NP40) | cells |
Eccles:Protein Lysates from Tissue | protein | detergent, physical, freezing | tissue |
RNA extraction using trizol/tri | RNA | phenol | cells |
Sauer:RNA Purification from E. coli | RNA | various options | bacteria |
add another method''s name | target | lysis method | type of starting material |
2023年3月18日,《CellStemCell》期刊以封面文章的形式在線發表了中國科學院腦科學與智能技術卓越創新中心(神經科學研究所)、神經科學國家重點實驗室陳躍軍研究組題為《人神經分化過程中跨時間......
研究表明,人造光(artificiallight)是引發機體代謝紊亂的一種高風險因素,然而,光調節機體代謝背后的神經機制,目前研究人員并不清楚。近日,一篇發表在國際雜志Cell上題為“Lightmod......
雖然許多原核生物都有糖酵解的替代品,但它被認為是真核生物中唯一產生能量的葡萄糖分解代謝途徑。2023年2月8日,北京化工大學JensNielsen與劉子鶴共同通訊在Cell 在線發表題為”F......
載脂蛋白E的三種亞型(APOE2,APOE3和APOE4)僅在兩個氨基酸位置上存在差異,但其免疫調節作用卻截然不同。這種APOE亞型依賴的潛在機制仍然是謎。2023年1月2日,西湖大學施一公團隊在Ce......
骨骼肌是執行機體運動功能的主要組織器官之一。與衰老相關的骨骼肌質量和功能減退被稱為肌肉減少癥(Sarcopenia,肌少癥),這種疾病將導致老年人運動能力、平衡能力等身體機能的顯著下降骨骼肌是執行機體......
衰老,是一個復雜、多階段、漸進的過程,發生在生命的整個過程。隨著時間的流逝,人體的器官、肌肉會逐漸衰老,一些疾病也伴隨著年齡的增長而發生,包括癌癥、糖尿病、心血管疾病等。 近幾年......
在一項新的研究中,來自美國懷特海德研究所和布羅德研究所的研究人員利用一種新穎的、集合的、基于成像的篩選方法系統性地評估了5000多個人類必需基因的功能。他們的分析利用CRISPR/Cas9來敲除基因活......
“我們沒有用到精子、卵子和子宮,僅用干細胞就培育出了合成小鼠的胚胎模型。”一篇發表在Cell上的論文,這兩天簡直火出圈了,起因就是作者JacobHanna介紹論文時說的這番話。從實驗結果來看,合成的胚......
目前全世界有數以億計的男性,女性甚至是兒童飽受脫發困擾,遺傳、衰老、分娩、癌癥治療、燒傷以及壓力等都可能導致脫發。脫發雖然不會造成嚴重的健康問題,但是因為影響美觀,會導致個人形象問題,并因此帶來情緒創......
2022年6月15日,天津醫科大學劉強團隊(天津醫科大學為第一單位)在Cell 在線發表題為“Bonemarrowhematopoiesisdrivesmultiplesclerosispr......