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  • 發布時間:2019-05-20 19:26 原文鏈接: 胚胎中細胞基因打靶方法

    胚胎中細胞基因打靶方法

    置換型設計物的制備

    1.選擇靶基因的一個部分作為設計物的組成,還包括有靶基因的另一個部分作為Southern雜交探針,以鑒定細胞中是否已發生同源重組之用。

    2.在質粒載體中構建一個克隆;neo基因能阻斷靶基因的表達,在neo的兩側保持保留同源區;在同源區外的置換型設計物中包含一個胸腺嘧啶激酶(TK)基因。

    3.用限制性內切酶消化設計物DNA使成線形;設計物DNA線形化后,質粒DNA仍附于在TK基因上。如果設計物在基因組發生隨機插入中出現任何DNA序列丟失時,線性態有助于保持TK基因的活性。

    4.用酚/氯仿抽提設計物DNA

    5.用加兩個體積的95%乙醇沉淀,微型離心機離心30秒,去上清,使沉淀物干燥到仍保持微濕潤狀態。

    6.把沉淀物溶于100μl水中,檢測是否已被徹底消化,在凝膠電泳中測定DNA的濃度。

     

    轉染設計物和ES細胞的選擇

    7.把細胞培養在ES/LIF培養基中;每23天傳代細胞,把細胞接種到100mm凝膠培養皿上,每皿12×106細胞。

    8.用胰蛋白酶/EDTA消化收集細胞達5×1061×107;消化5分鐘,令細胞完全脫壁,用吸管吹打使分散成單細胞,加5ml ES培養液,用1ml電擊液重懸于同一管中。

    9.1 pmol消毒線性DNA

    10.  450V250μF4mm電擊小室中進行電擊;室溫中培養10分鐘。

    11.  ES細胞培養在ES培養液中,按12×106細胞/100mm凝膠培養皿上,培養24小時。

    12.  更換入含有G4182mg/ml終濃度)和GANC2μM終濃度)的ES/LIF培養液中,進行篩選。

    13.  繼續培養,每日更換一次ES/LIF培養液和加有G4182mg/ml終濃度)及GANC2μM終濃度),繼續篩選直到單個、分離的克隆出現為止(典型情況下,電擊后1周內出現);用一個高壓消毒過的吸管從培養皿中分離出單個克隆,置入35μl胰蛋白酶/EDTA液中消化5分鐘;反復吹打5次分散細胞,把細胞轉入鋪有凝膠和每孔含有1ml ES/LIF培養液24孔培養板中。

    14.  培養至克隆出現,但細胞無分化(34天);半數細胞傳代鋪有凝膠24孔板中監視,把剩余的細胞加入到0.5ml凍存培養液中,-70℃過夜,次日轉入液氮中。

    15.  監視ES細胞,在24孔培養板中培養至接近匯合(通常23天);在此階段中對防止ES細胞發生分化并非十分嚴格,在培養液中也可不加LIF,但在LIF存在情況下,利于對細胞的生長。

    16.  300μl消化緩沖液,轉入1.5μl微型離心管中,在55℃中培養過夜。

    17.  150μl飽和NaCl,強烈旋轉。加2體積的95%乙醇。有一些學者用兩體積的乙醇沉淀DNA但不加鹽。

    18.  DNA沉淀重懸入50μl水中,OD260吸收值測DNA濃度。

    19.  消化10μg DNA,再加適當內切酶酶解。

    20.  把消化的DNA1%瓊脂糖凝膠電泳,把不同長度的DNA片段分離開,轉移到尼龍膜上,做Southern吸印轉移,選用從步驟1中的探針進行雜交,把無改變的靶基因,從已發生同源重組的靶基因中區分出來。

    21.  篩選ES細胞,顯示有兩個近于相同強度的雜交片段;一個應為無改變的靶基因,另個應為發生同源重組的靶基因。如果兩個片段顯示呈現不同雜交強度,則細胞群可能不是克隆群。細胞凍存于液氮中。


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