1．質粒快速鑒定
試劑：
Protoplasting buffer:
30mM Tris-HCl, pH8.0 0.33ml/1.0M
5mM EDTA 0.1ml/0.5M
50mM NaCl 0.1ml/5.0M
20% Sucrose 5ml/40%
50μg/ml RNAseI 50ul/10mg/ml
50μg/ml lysozyme 50ul/10mg/ml
補水至10ml，-20℃分裝保存。
Lysis buffer:
89mM Tris-HCl, pH8.0
89mM boric acid 2ml of 5×TBE
2.5mM EDTA
2% SDS 2ml of 10%
5% sucrose 1.25ml of 40%
0.04% bromphenol blue 4mg
補水至10ml，-20℃分裝保存。
步驟：
1．將轉化后的菌液鋪平板，37℃過夜培養。
2．配制0 .6--0 .7%的瓊脂糖TBE 膠。
3．用連續加樣槍在96孔板中每孔加入10 μl Photoplasting Buffer。
4．用滅過菌的10ul小槍頭挑取單克隆白斑至含有Photoplasting Buffer 的96孔板中，振蕩混勻。
5．用連續加樣槍將Lysis Buffer上樣于凝膠中，每孔4 μl，用排槍將細胞與Protoplasting buffer混合液上樣于凝膠中（細胞在Protoplasting buffer中不宜超過30-40 min），并點上Marker。
6．調節電壓為20V（小槽）或40V（大槽），電泳15min，使細胞充分裂解，將電壓調高到200V，繼續電泳1hr，照相。
7．根據膠圖粗略鑒定插入片段的大小及小片段率。
2．菌落PCR
1．取適量PCR薄壁管，置于冰上，每管先加入17.3ul的滅菌水。
2．用滅過菌的10ul小槍頭挑取單克隆白斑至滅菌水中，振蕩混勻。
3．依次加入：
10xbuffer 2.5
Mgcl2(25mM) 1.8
DNTP(2.5mM) 1
T3 引物（10pmol） 1
T7 引物（10pmol） 1
Taq酶 0.4
total 25ul
各試劑均加好后，離心機上甩一下，使之沉底，置于PCR儀上
4．94℃，2min。
5． 94℃ 4分鐘
94℃ 40秒
53.6℃ 40秒 35個循環
72℃ 4分鐘
72℃ 10分鐘
4℃ 24小時
6．待PCR反應進入4℃后，取下PCR薄壁管，取7ulPCR產物加入3ul溴芬蘭跑電泳，同時上1Kb DNA ladder。半小時后照相，觀察膠圖，根據膠圖粗略鑒定插入片段的大小及小片段率。
7．將快速鑒定和菌落PCR檢測合格的文庫送檢。