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1. 盡管當插入片段大于100 kb 時，YAC克隆是可供選擇的基因組DNA大片段克隆方法之一，但該系統的一些特性使之很難被迅速采納為常規克隆手段。
2. 在復雜的釀酒酵母菌的基因組中，通常所用的YAC只是一個單拷貝。
3. 因此在YAC文庫中鑒定一個克隆，其信噪比較之在λ噬菌體載體或粘粒載體文庫中鑒定同種的克隆更差。
4. 同時，發展一種針對YAC的高密度篩選方法的努力一直步履維艱，僅取得了十分有限的成功，構建YAC文庫時不僅需要百倍的努力和巨大的投入，篩選文庫時還要耗費大量的人力物力。因此，如果研
5. 究者希望獲得含特定序列DNA的YAC克隆，最為可行的方案是首先安排篩選在某中心實驗室保存的已有的文庫。 6. 最初，YAC文庫是用整個棊因組DNA構建的。近來，也有利用攜帶特定染色體或部分染色體的體細胞雜合體構建文庫。
7. 如果靶基因座在染色體上的位置是已知的，那么構建和篩選YAC文庫所耗費的人力物力將極大地減少。
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