飛行時間質譜儀類型有多種。
1、按分析目的可分：化驗室飛行時間質譜儀和工業飛行時間質譜儀。
2、按分析對象的狀態可分：飛行時間原子質譜儀和飛行時間分子質譜儀。
3、按分析對象的屬性可分：飛行時間有機質譜儀、飛行時間無機質譜儀和飛行時間同位素質譜儀等。
4、按用途可分：飛行時間生物質譜儀、飛行時間制藥質譜儀、飛行時間化工質譜儀、飛行時間食品質譜儀、飛行時間醫用質譜儀、飛行時間酒精質譜儀、飛行時間催化劑質譜儀、飛行時間試劑質譜儀和飛行時間核工業質譜儀等。
