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  • 發布時間:2020-02-12 23:00 原文鏈接: 如何使用NMR對生物樣本研究?

    高分辨率 NMR 已快速發展成為體液和組織分析中的主要工具。它可用于高通量且一鍵式全自動化地生成譜圖數據,從這些數據中可自動定量生物標志物的含量,或與健康或疾病狀態的統計模型相比較。由于其卓越的重現性和在不同實驗室間的可轉移性,它還可用于大規模流行病學研究。這些優點,加上標準操作流程和標準化工具平臺,可將世界各地生成的數據與來自生物樣本庫網絡的數據整合在一起。

    NMR 與生物樣本庫及其日常工作的關系怎樣?

    NMR 可用于樣本納入生物樣本庫時的質量控制,同步產生的測量數據還可作為額外產生的分析數據而增加樣本存儲的附加價值:

    • ? 驗證樣本的類型,例如判定EDTA(乙二胺四乙酸)血漿、枸櫞酸鹽血漿,以及質量控制、檢查污染和雜質

    • ? 生成每個樣本的 NMR 譜圖,用于輸入生物樣本庫信息,其中NMR 譜圖在標準條件下生成,可用于世界范圍內不同生物樣本庫的整合波譜庫

    • ? 同步生成包含114個參數的血清/血漿的脂蛋白亞分析數據

    • ? 增加一系列尿液定量數據,包括每個代謝物的參考濃度范圍

    NMR 用于波譜數據庫應用和數據交換的適合性

    同樣 SOP 下、使用標準化 NMR 平臺的 NMR 分析的重現性和可轉移性見圖 3。血清樣本的等分樣已經過制備和檢測,使用同一儀器單獨制備和檢測的 15次重復測定之譜圖疊圖顯示在上部,而下部疊圖顯示的是在同樣 SOP 下、使用同一型號儀器在兩個實驗室分別采集的8個譜圖數據的疊圖。可以看出來,所有譜圖都完美重疊。這證明來自不同生物樣本庫的譜圖數據可用于綜合統計分析。因此,對于新的研究,可使用譜圖數據來代替取自生物樣本庫的新等分樣。

    使用分析數據給生物樣本庫增加價值

    無論是哪個生物樣本庫,與樣本有關的元數據都很重要。這些數據可以是患者數據、生活方式信息,也可以是分析數據,例如血漿/血清中的脂蛋白(包括亞類)濃度,尿液中內源性代謝產物的濃度等。通過直接使用質控時獲得的譜圖,可自動生成分析結果,包括從所有生物樣本庫測試樣品所得到的各代謝物濃度的參考范圍。
     


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