普通顯微鏡有許多局限性。對于初學者來說，通常情況下只限于通過目鏡來觀察顯微物體。一眨眼的時間，很有可能就會錯過一些剛才觀察到的顯微圖像。
另外，觀察者除了通過自己的描述外沒有其他辦法將剛才觀察到的顯微圖像保存下來。用眼睛觀察到的顯微圖像只能通過觀察者的文字描述來和他人共享。
普通顯微鏡最明顯的局限性還在于觀察者的視野范圍受到了限制。因為鏡頭尺寸小，所以每次只能研究一小塊區域。
如果想查看物體表形，就需要不斷的移動載物臺來查看物體的全貌。
以上這些限制通過數碼顯微鏡都能得到有效的解決。
數碼顯微鏡通過USB數據線連接到電腦，從顯微鏡目鏡看到的顯微圖像能在電腦顯示器中實時預覽。
當然，數碼顯微鏡能做的遠遠不止這些。
通過數碼顯微鏡你可以建立自己的顯微圖片庫。這意味著你能把顯微圖片保存下來供日后的觀察及滿足進一步研究的需要。
此外，拍攝的顯微圖片還可以進行編輯處理。
想更近距離的觀察顯微物體表形的特定區域嗎? 通過數碼顯微鏡的數碼放大功能，能看到的圖像比肉眼通過常規顯微鏡看到的要大30倍、50倍，甚至100倍。
想和他人共享你的發現嗎?因為你已經將圖片保存下來了，所以共享將會變得十分簡單。
目前，數碼顯微鏡在世界上許多工業領域已經成為重要的工具。
在醫學領域，尤其是實測復雜活體活動的研究中，數碼顯微鏡的應用價值也是無價可估的。
想要鑒別錢幣和郵票的集郵愛好者們將會發現數碼顯微鏡將給他們帶來的種種益處。
業余愛好者們也將會發現數碼顯微鏡的優勢。當然，從事研究事業的朋友們使用數碼顯微鏡將會得更多的多產期。