突變率驚人！新冠患者病毒存在快速進化風險

　　國際學術期刊《臨床傳染病》（Clinical Infectious Diseases）日前刊發來自中國研究團隊的一篇名為《新冠病毒在患者體內的基因多樣性（Genomic diversity of SARS-CoV-2 in Coronavirus Disease 2019 patients）》論文，研究結果顯示，一些新冠病毒感染者體內發現了病毒多樣性水平升高，這表明新冠病毒存在快速進化的風險。

　　不過還沒有發現新冠病毒在宿主內變異（intra-host variants）傳播的證據，但也不應忽視這種風險。

　　該論文通訊作者為中國科學院北京基因組研究所研究員、博士生導師李明錕，研究團隊成員來自多個單位，包括中國科學院北京基因組研究所；中國科學院大學；國家衛健委重點實驗室，中國醫學科學院病原生物學研究所；北京大學生物醫學前沿創新中心；北京大學人民醫院呼吸與危重癥醫學科；廣東省新發傳染病診治重點實驗室，新發傳染國家重點實驗室；福建人民醫院；西安交通大學第一附屬醫院；中國科學院動物進化與遺傳前沿交叉卓越創新中心等。

　　研究團隊對8例新冠肺炎患者，25例社區獲得性肺炎患者和20例健康對照者的支氣管肺泡灌洗液進行了轉錄組測序。并在一些新冠病毒感染者體內發現了病毒多樣性水平升高，這表明病毒存在快速進化的風險。

　　研究者對8名患有新冠病毒感染者的支氣管肺泡灌洗液樣本進行了轉錄組測序。通過對2019年12月24日至2020年2月9日之間收集到的110個新冠病毒基因序列研究發現，發生在宿主內的變異數量在0到51之間，中位數為4，表明新冠病毒的進化速率很高。

　　研究團隊總共鑒定出了84個宿主內變異，其最小等位基因頻率（MAF，通常是指在給定人群中的不常見的等位基因發生頻率）大于5％，而25個變異的MAF大于20％。

　　值得注意的是，新冠病毒在不同的病人中產生的宿主內變異數量顯示出；較大的差異（MAF≥5％的變異為0到51，中位數為4； MAF≥20％的變異為0到19，中位數為1），研究人員認為，這不能用患者被感染的批次、病毒覆蓋范圍差異或污染來解釋。并且研究者發現，新冠病毒發生變異的數量與患者發病天數或其年齡無關。

　　其中，6號病人體內產生了極高水平的病毒變異，共出現了51個變體，但研究者并未能找到這種現象發生的原因。

　　研究人員認為，由于RNA病毒具有很高的突變率。因此RNA病毒容易產生對藥物的抗性并逃避免疫監視。但新冠病毒的突變率仍不清楚。不過這項研究得出新冠病毒的突變率應與SARS病毒處于相同的數量級。而新冠病毒宿主內頻率≥5％的變異體中位數為4，該發生率與埃博拉病毒病研究中報道的發生率無明顯差異，這表明新冠病毒的突變率也與埃博拉病毒相當。

　　此前北京大學生命科學學院生物信息中心與中國科學院上海巴斯德研究所科研人員的研究表明，新冠病毒已于近期產生了149個突變點，并演化出了兩個亞型，分別是L亞型和S亞型。其中S型是相對更古老的版本，而L亞型更具侵略性傳染力更強。