生物芯片的制作主要有光引導原位合成法、電噴射原位合成法、接觸式點涂法和非接觸噴射法(通過壓電晶體或其他推進形式)四種，前兩種方法都是在芯片上直接合成探針，后兩種方法是把事先已制備好的探針樣品(如通PCR方法)移植固定在玻璃或硅片上，通常通過電腦自動化操作呈陣列狀分布。其中最經濟高效的還是后兩種方法。
接觸式點樣和非接觸式點樣各有優點：
性能上：接觸式芯片點樣儀控制精度低于非接觸式芯片點樣儀，點出的微小液滴圖案也不如非接觸式點樣更接近圓形。但壓電陶瓷噴頭在處理黏稠度較大的液體時顯得非常困難，采用的解決辦法是對噴頭腔體進行加熱，但加熱會造成蛋白變性，所以對熱敏感的樣品，無法進行點樣;而接觸式芯片點樣儀對各類黏稠度的樣品基本上都可以工作。
強度上：接觸式點樣針更安全，因為針體結構簡單，工作過程中，針體在針導向槽內滑動，所以點樣動作比較安全;而壓電噴頭結構復雜，點樣頭固定在噴頭上，上下運動稍有不慎就會損壞壓電噴頭，操作起來安全性較低。
這兩種芯片點樣儀都互相不可替代。接觸式芯片點樣儀已經很成熟，價格也基本穩定，是點樣設備的主流。非接觸式芯片點樣儀，只有少數公司具備噴頭的設計加工能力，而且噴頭屬于耗材，目前成本高，售價單支1萬元人民幣左右，在制備技術和成本方面還有較大的開拓空間。