dek35編碼PPR蛋白影響玉米籽粒的線粒體nad4基因內含子1的順式剪接和發育
農林RNA測序助力玉米籽粒dek35突變體研究
該研究與前幾天RNA測序在玉米籽粒dek2突變體中分子機制的研究應用相似，研究的主角依然是上海大學生命科學學院，該工作主要由陳鑫澤博士完成。研究對象由dek2突變體變為了dek35突變體。
研究思路
研究結果
dek35突變表現出發育遲緩的表型
本研究中dek35突變來源于美國玉米種質中心，編號為5605F。其表現出小籽粒，并且頂部種皮中空（圖1）。突變體百粒重只有野生型20%（dek2是35%）（圖1）。總淀粉、直鏈淀粉和總儲藏蛋白含量沒有顯著變化，醇溶蛋白在突變體中顯著下降。亞細胞層面觀察發現，胚乳轉移層細胞（BETL）在突變體中發育遲緩，表明籽粒發育受到抑制（圖1）。
dek35基因克隆
研究人員對dek35突變體進行圖位克隆，將其定位于玉米1號染色體254,244,136 bp to 289,337,516 bp大約35M區段內。由于該突變來源于Mutator突變系，研究人員懷疑其可能含有Mu的插入（圖2）。對其進行Mu標簽分離表明，一個Mu標簽存在于35M的區段內，插入在了GRMZM2G066749起始密碼子下游30bp處。該結果同樣通過等位測試驗證（圖2）。
dek35編碼了一個P-type PPR蛋白
研究人員通過將GRMZM2G066749蛋白編碼序列在數據庫中比對后發現，該基因編碼了一個P-type PPR蛋白（圖2）。
dek35在籽粒發育過程中持續性表達
研究人員通過定量PCR以及Western Blot雜交發現，dek35是一個全組織表達的基因（圖3）。
dek35定位于線粒體中
將dek35連接入熒光表達載體，使其與黃色熒光蛋白YFP融合，并對其共聚焦顯微鏡亞細胞定位研究。結果發現，dek35定位于線粒體內嵴（圖4）。
