蛋白質組學發文章的四重境界（二）

譯文：細胞+基因芯片+iTRAQ+WB+功能驗證。遙想當初，很多老師意氣風發砸錢做芯片，數據堆積如山，一臉懵逼。然而如今世風日下，基因芯片灌水發文章很難上5分，怎么將課題繼續下去？其實芯片數據結合蛋白質組學可以玩出新花樣，比如下面這篇：

Cheng DD, Yu T, et al. MiR-542-5p is a negative prognostic factor and promotes osteosarcoma tumorigenesis by targeting HUWE1. Oncotarget. 2016. (IF=5.0)

作者甚至沒有臨床樣本，只在細胞水平通過miRNA芯片找到功能miRNA，隨后干擾miRNA，做細胞水平的iTRAQ，找到了miRNA的作用靶點，并進行了WB驗證，最終做了簡單的功能驗證，影響因子5.0分。

此外，在5分這一檔上，還有個iTRAQ灌水小神器：SCIENTIFIC REPORTS雜志(IF=5.2)。其中的蛋白質組研究套路非常簡明：臨床樣本+iTRAQ+數據分析+WB/IHC+功能驗證。對于經費緊張的老師，這是目前發5分文章性價比最高的方案之一。

譯文：臨床樣本+ iTRAQ + WB/IHC +功能驗證+臨床相關性。轉化醫學的輪回，就是從臨床出發，再回到臨床。若要將研究檔次再上一層樓，從5分向10分攀登，必然要回到大量臨床樣本的驗證中，將新發現的Biomarker的臨床相關性予以證實。下面這篇文章，若能在分子機制上略加探索，分數再上一層樓絕不是問題：

Chiung HH, Chia WH, et al. Identification and characterization of potential biomarkers by quantitative tissue proteomics of primary lung adenocarcinoma. Mol Cell Proteomics. 2016.(IF=5.9)

此時，發文章已經不再是唯一的目標，找到更有臨床價值的Biomarker，做成診斷試劑盒，申請專利，開公司，走上人生巔峰將不再是遙不可及的夢想。

譯文：臨床樣本 + iTRAQ + 蛋白質組對基因組的深度注釋。第四重功法變化多端，突破10分之后，每一項研究都飽含了深思熟慮，無法簡單重復，只可意會不可言傳，這里只能略舉一例：

Mertins P, Mani DR, et al. Proteogenomics connects somatic mutations to signalling in breast cancer. Nature. 2016. (IF=38.1)