生物樣本庫定義及種類
生物樣本庫又稱生物銀行(Biobank),是按需標準化收集、儲存、處理和/或發放生物樣本的實體機構。生物樣本庫涉及的樣本類型及相關信息主要包括:健康和疾病生物體的生物大分子、細胞、組織和器官等,如:人體器官組織、全血、血漿、血清、生物體液等;經處理的生物樣本(DNA、RNA、蛋白質等);生物樣本的臨床、病理、治療、隨訪、知情同意書等資料;生物樣本的質量控制、信息管理與應用等。
生物樣本庫有多種類型,常見的有:組織、器官庫(Tissue bank),如血液庫、眼角膜庫、骨髓庫等;細胞株(系)庫,包括正常細胞、遺傳突變細胞、腫瘤細胞和雜交瘤細胞株(系)等。近年來還出現了臍血干細胞庫、胚胎干細胞庫等各種干細胞庫。在人類疾病領域,一些研究單位根據自身專科優勢及特色病種,籌建了各種特色樣本庫,如腸癌庫、鼻咽癌庫、乳腺癌庫、肝癌庫、肺癌庫、食管癌庫、頭頸腫瘤庫、婦科腫瘤庫等。
生物樣本庫的意義
隨著后基因組時代的來臨,對基因的研究引發了新的研究方法和手段的誕生,密切了基礎醫學與藥物研發、臨床醫學之間的聯系,使人們可以更準確地理解環境和人類遺傳分子之間的相互作用,以期精確地描繪疾病發生的本質,從而改進目前對于疾病的診斷和治療,由此誕生了從實驗室到病床,把基礎研究所獲得的知識、成果快速轉化為臨床上治療的新方法,并通過新方法的實施反過來驗證基礎研究中發現理論或建立的新的理論,被稱為(B2B,Bench
to Bedside)模式,也稱其為轉化醫學(Translational Medicine)。
轉化醫學顯著應用涵蓋如下兩點:
1. 新型的生物標志物在臨床疾病檢測中的應用;
2. 加快新藥研究的速度。
轉化醫學的應用離不開基礎研究的成果,這些成果需由大樣本、大數據信息的支持。因此,需建立專門的、標準化的生物樣本庫(Biobank),大規模、高效地搜集和利用生物樣本、生物信息和數據,保證轉化醫學研究的需要。這種方式對于提高科研效率有極大的幫助,對于轉化醫學的發展具有顯著的促進作用。
生物樣本庫標準化及發展趨勢
《正如用于功能基因組研究組織生物樣本庫存在的問題-2000項分析》一文中所指出的,目前我國生物樣本庫存在如下問題:
(1)保持方式單一:僅石蠟或液氮;
(2)收集不配對:腫瘤、癌旁、正常;
(3)樣本收集不全面:僅組織或血(全血、血清、血漿),缺乏重要的體液;
(4)臨床信息不完整:缺治療、隨訪;
(5)研究深度、廣度嚴重受限;
(6)耗材、取樣時間、運輸等五花八門;
(7)缺乏標準化流程、質控、安全保障、信息化管理體系,缺乏專業隊伍;
(8)醫院、科室、內專家之間相互封閉、條塊分割;
(引自視為樣本庫最佳實踐ISBER 2012 資料)
基于以上原因,通過調查走訪,目前國內眾多生物樣本庫中,“黃金庫”、“價值庫”數量不夠多,同時還存在一些“垃圾庫”、“死庫”等現象。
中國醫藥生物技術協會組織生物樣本庫分會各位專家通過討論,提出了標準化生物樣本庫涵蓋內容:
(1)A 理論委員會+ B 知情同意書
(2)C 實體庫(技術標準化)組織(癌、癌旁、“正常”)、(液氮、福爾馬林等)血清、血漿、全血、胰液、尿糞、胸腹水、CTC、肝細胞、微生物(細菌—Hp及耐藥菌株—腸道微生物菌群、病毒等)、細胞;環境:水、土壤、農作物食品等
(3)D 合格衍生物:DNA、RNA、蛋白、MicroRNA病原體、細胞等(第三方控制)
(4)E 臨床資料庫(共同臨床信息庫)臨床資料(病史C/A、臨床病理、治療、隨訪)
(5)F 研究數據庫——共享機制
(6)G 轉化醫學(協同創新與轉化)
(引自生物樣本庫最佳實踐ISBER 2012 資料)
進入二十一世紀以來,隨著現代生物科技的快速發展,分子遺傳學取得了巨大的發展,國內外對于人類遺傳資源的保護與開發研究勢頭強勁,各國科學家普遍認為,生物樣本庫的發展趨勢應具備如下特點:
(1)標準化:如通過行業標準認證、國家標準認證、資質論證等。
(2)專業化:生物樣本庫建設需要由專業的團隊,相關的課題組及研究院相互合作完成。
(3)特色化:生物樣本庫的建設不以數量為原則,而應以質量為原則,以共享利用為原則。
(4)信息化:充分利用計算機技術,網絡技術,實現數據共享,籌建中國虛擬樣本數據庫。
(5)集約化:在標準化前提下資源庫的大型化,如第三方存儲中心——生物銀行。
(6)國際化:在生物樣本庫管理教育培訓、質控標準等方面實現國際化。
(7)價值化:各個國家內部研究機構和國家之間對資源庫的共同建設和共享,完善充分應用機制。
(8)自動化:高端、高效、高質、安全
(引自生物樣本庫最佳實踐ISBER2012 資料)
Hamilton 產品在生物樣本庫領域應用
生物樣本庫日常樣本處理工作通常包含如下幾個部分:(1)生物樣本采集及收集;(2)生物樣本制備,如血液樣本組份分裝等;(3)生物樣本及數據信息存儲;(4)生物樣本處理及出庫供給,如核酸提取等。
Hamilton 公司成立于1947年,其液體處理工作站的技術及自動化樣本存儲技術在全球范圍內都處于領先地位。在生物樣本庫應用領域,Hamilton 根據生物樣本庫日常樣本處理工作內容,能夠提供一站式解決方案,實現全部工作流程的自動化。
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