DNA合成儀合成原理：
DNA的固相合成:即DNA3'端固定于基質上，然后沿3'向5'方向依次添加核苷酸直至合成所需的DNA片段。不同于應用DNA聚合酶的DNA合成。
合成過程:
第一個堿基的3‘末端固定在樹脂上，下一個堿基的5’-OH用二對甲氧三苯甲基DMT保護，堿基上的氨基用苯甲酸保護，然后對3‘-OH用氨基磷酸化合物進行活化。
1.1個堿基的5’-OH和下個堿基的3‘-OH形成亞磷酸三酯
2.然后用碘氧化成磷酸三酯
3.加入二氯乙酸除去第二個堿基5’-OH上的保護劑DMT
循環進行加入下一個堿基合成完畢后
1.用苯硫酚除去5’-OH上的保護劑DMT
2.用濃氫氧化銨將片段與固體樹脂斷開，洗脫
3.用濃氫氧化銨在加熱的條件下除去堿基上的保護劑
4.除去氫氧化銨，真空抽干
5.液相色譜或者PAGE，回收片段最長的。