3.4分子標記技術與遺傳多樣性
研究了將魚類基因內含子作為遺傳多樣性評價指標的可行性，應用SSCP和定序的方法研究了大西洋和地中海幾種海洋生物的遺傳多樣性。研究了南美白對蝦消化酶基因的多態性；利用寄生性原生動物和有毒甲藻基因組DNA的間隔區序列作標記檢測環境水體中這些病原生物的污染程度，應用18S和5.8
S核糖體RNA基因之間的第一個內部間隔區(ITC—1)序列作標記進行甲殼類生物種間和種內遺傳多樣性研究；研究了斑節對蝦三個種群的線粒體DNA多態性，用PCR技術鑒定了夏威夷Gobioid苗的種類特異性。通過測定內含子序列揭示了南美白對蝦的種內遺傳多樣性，采用同功酶、微衛星DNA及RAPD標記對褐鱒不同種群的遺傳變異進行了評價，在平魚鑒定并分離出12種微衛星DNA，在美國加州魷魚上發現了高度可變的微衛星DNA；弄清了一種深水魚類（Gonostoma
gracile）線粒體基因組的結構，并發現了硬骨魚類
tRNA基因重組的首個實例，測定了具有重要商業價值的海水輪蟲的衛星DNA序列，用RAPD技術在大鯪鲆和鰨魚篩選到微衛星重復片段，從多毛環節動物上分離出高度多態性的微衛星DNA，用RAPD技術研究了泰國東部泥蟹的遺傳多樣性；用AFLP方法分析了母性遺傳物質在雌核發育條紋鱸基因組中的貢獻。
3.5 DNA疫苗及疾病防治
構建了抗魚類壞死病毒的
DNA疫苗；開展了虹鱒IHNV DNA疫苗構建及防病的研究，表明用編碼IHNV糖蛋白基因的DNA疫苗免疫虹鱒，誘導了非特異性免疫保護反應，證明DNA免疫途徑在魚類上的可行性，從虹鱒細胞系中鑒定出經干擾素可誘導的蛋白激酶；建立了養殖對蝦病毒病原檢測的ELISA試劑盒，用PCR等分子生物學技術鑒定了蝦類的病毒性病原，將魚類的非特異性免疫指標用于海洋環境監控，研究了抗病基因轉移提高鯛科魚類抗病力的可行性，研究了蛤類唾液酸凝集素的抗菌防御反映；研究了一種海洋生物多糖及其衍生物的抗病毒活性；建立了測定牡蠣病原的PCR—ELISA方法；研究了Latrunculin
B毒素在紅海綿體內的免疫定位。
3.6生物活性物質
從海藻中分離出新的抗氧化劑，建立了大量生產生物活性化合物的海藻細胞和組織培養技術，建立了通過海綿細胞體外培養制備抗腫瘤化合物的方法；從不同生物（如對蝦和細菌）中鑒定分離出抗微生物肽及其基因，從魚類水解產物中分離出可用作微生物生長底物的活性物質，海洋生物中存在的抗附著活性物質，用血管生成抑制劑作為抗受孕劑，從蟹和蝦體內提取免疫激活劑，從海洋藻類和藍細菌中純化光細菌致死化合物，海星抽提物在小鼠上表現出批精細胞形成的作用，從海洋植物Zostera marina分離出一種無毒的抗附著活性化合物，從海綿和海鞘抽提物分離出抗腫瘤化合物，開發了珊瑚變態天然誘導劑，從海膽中分離出一種抗氧化的新藥，在海洋雙鞭毛藻類植物中鑒定出長碳鏈高度不飽和脂肪酸（C28），表明海洋真菌是分離抗微生物肽等生物活性化合物的理想來源；發現海洋假單胞桿菌的硫酸多糖及其衍生物具有抗病毒活性，從硬殼蛤分離出谷光甘肽一S一轉移酶，從鯉血清中分離出絲氨酸蛋白酶抑制劑，從海綿中分離出氨激脯氨酸二肽酶，從一種珊瑚分離出具DNA酶樣活性的物質，建立了開放式海綿養殖系統，為生物活性物質的大量制備提供了充足的海綿原料；從蝦肌水解產物中分離到抗氧化肽物質。
3.7生物修復、極端微生物及防附著
研究了轉重金屬硫蛋白基因藻類對海水環境中重金屬的吸附能力，表明明顯大于野生藻類，研究了石油降解微生物在修復被石油污染的海水環境上的可療性及應用潛力；研究了海洋磁細菌在去除和回收海水環境中重金屬上的應用潛力；用Bacillus清除養魚場污水中的氮，用分子技術篩選作為海水養殖餌料的微藻，開發了六價鉻在生物修復上的應用潛力，分離出耐冷的癸烷降解細菌，研究了海洋環境中多芳香化烴的微生物降解技術；從噬鹽細菌分離出滲透壓調節基因，并生產了重組Ectoine（滲透壓調節因子），從2650米的深海分離到一種耐高溫的細菌，這種細菌可用來分離耐高溫和熱穩定的酶，在耐高溫的archaea發現了D型氨基酸和無氧氨酸消旋酶，測定了3種海洋火球菌的基因組DNA序列，借助于CROSS／BLAST分析進行了特定功能基因的篩選，從海底沉積物、海水和北冰洋收集了1000多種噬冷細菌，并從這些細菌中分離到多種冷適應的酶；建立了一種測定藤壺附著誘導物質的簡單方法，研究了Chlorophyta和共生細菌之間附著所必需的形態上相互作用，研究了珊瑚抗附著物質（dterpene）類似物的抗附著和麻醉作用；分析了海岸環境中污著的起始過程，并對沉積物和附著物的影響進行了檢測。
4．展望與建議
上述研究分析表明，海洋生物技術作為一個全新的學科，已成為21世紀海洋研究開發的重要領域，并沿著三個應用方向迅速發展。一是水產養殖，其目標十分清楚就是要提升傳統產業，促使水產養殖業在優良品種培育、病害防治、規模化生產等諸多方面出現跨越式的發展；二是海洋天然產物開發，其目標是探索開發高附加值的海洋新資源，促進海洋新藥、高分子材料和功能特殊的海洋生物活性物質產業化開發；三是海洋環境保護，其目標是保證海洋環境的可持續利用和產業的可持續發展。令人可喜的是這個應用發展趨勢與我國海洋產業的發展需求，特別是與我國海洋生物資源可持續開發利用的高技術需求相一致。事實上，在過去5年中我國海洋生物技術的研究應用已經取得了長足的進步，取得了一批具世界先進水平的研究成果，在推動海洋產業發展中發揮了重要作用。進入21世紀，加大海洋863的支持力度，進一步促進我國海洋生物技術快速發展的勢頭，不僅有現實的意義，也是具有戰略價值的舉措。另外，面對科技全球化的挑戰，多渠道地加強國際合作與交流，促進我國海洋生物技術創新和產業化向更高層面上發展也是十分重要的。
從技術應用的角度看，海洋生物技術主要是利用海洋環境特殊性和生物多樣性特征，從分子和細胞水平上，即從高技術水平上多層面地開發利用海洋生物群體資源。遺傳資源和天然產物資源，那么與此相關的基礎研究就顯得十分重要了。事實上，這也是一種國際研究發展趨勢。為了彌補這方面的不足，在我國海洋生物技術發展過程中需要有多方面支持和配合，不僅要與《國家重點基礎研究發展規劃》、《國家自然科學基金》等相關計劃溝通、銜接，還需要加強基礎性建設。既需要加強中試基地和產業化基地建設，也需要加強基礎設施建設，如加強開放實驗室、研究基地、生物多樣性資源庫、種子庫、信息數據庫的建設。這些措施對我國海洋生物技術向更高水平發展具有深遠意義.