實驗材料 合成的核酶分子切割底物RNA
試劑、試劑盒 Tris-HClMgCl2
實驗步驟
一、材料與設備
1)500 mmol/LTris-HCl(pH7.4)
2)100 mmol/LMgCl2
3) 合成的核酶分子
4) 切割底物 RNA
二、操作方法
1) 制備切割混合構:不超過 l0 pmol 底物 RNA,l pmol 合成的核酶分子,加水至 8ul, 加 l ul 500 mmol/L Tris-HCl(PH7.4),混勻。
2) 于 75℃ 加熱 1 min, 然后置于冰上。
3) 加 1ul 100 mmol/L,MgCl2 于 42℃ 孵育 lh。
4) 變性聚丙烯酰胺凝膠電泳分離,回收。
注意事項
1) 切割底物 RNA 和核酶可以通過體外轉錄的方式獲得。
2) 切割底物 RNA 要與核酶匹配,若底物與核酶具較長的堿基配對則可以提髙酶切的特異性,但會降低切割轉換數,因此一般選擇 5-7 個核苷酸作為互補匹配區。
3) 為獲得最佳的切割效果,底物 RNA、核酶的用量,鎂離子的濃度、反應溫度和反應時間均應通過試驗確定。