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  • 發布時間:2020-08-11 11:00 原文鏈接: 真菌RNA提取實驗

    實驗方法原理

    液氮研磨可裂解細胞,促使核蛋白體的解離,使RNA與蛋白質分離,并將RNA釋放到溶液中。當加入氯仿時,它可抽提酸性的苯酚,而酸性苯酚可促使RNA進入水相,離心后可形成水相層和有機層,這樣RNA與仍留在有機相中的蛋白質和DNA分離開。

     

    實驗材料 菌絲體

    試劑、試劑盒 NaCl蒸餾水SDSTris-HClEDTADEPCSSTE乙醇酒精酚:氯仿:異戊醇LiCl

    儀器、耗材 液氮罐離心管離心機水浴鍋冰箱紫外分光光度計電泳儀

    實驗步驟

    一、實驗試劑準備

     

    1.  RNA提取緩沖液(CTAB):2% CTAB(W/V),2% 聚乙烯吡咯烷酮PVP(W/V),100 mM Tris-HCl(pH8.0,DEPC處理的水配置),25 mM EDTA,0.5 g/L 亞精胺Spermidine,2.0 M NaCl,2%巰基乙醇(V/V,使用前加入)。由于在高溫滅菌條件下,Tris-HCl要和DEPC發生反應,所以配RNA提取緩沖液時直接用DEPC處理的水配制即可。

     

    2.  SSTE:1 M NaCl,0.5% SDS(W/V),10 mM Tris-HCl pH8.0,1.0 mM EDTA。

     

    3.  10 M LiCl 直接用蒸餾水配10 M LiCl,加1‰的DEPC過夜后,高溫滅菌。


    4.  DEPC處理水 用1‰的DEPC處理蒸餾水過夜,高溫滅菌。

     

    5.  3M NaAc,氯仿:異戊醇(24:1),酚(pH4.5):氯仿:異戊醇(25:24:1),無水乙醇,70%酒精。


    二、實驗步驟

     

    1.  實驗開始前將RNA提取液于65℃水浴鍋中預熱,離心管中加入ME(巰基乙醇),(10 mL加80 ul,50 mL中加入300 ul)。

     

    2.  取約0.8 g菌絲體(液體培養獲得的菌絲用真空抽濾即可,固體培養就更好說了),在液氮中迅速磨成精細粉末,裝入50mL離心管,按1g材料8 mL的量加入預熱的RNA提取液,顛倒混勻。

     

    3.  65℃水浴3-10 min,期間混勻2-3次。

     

    4.  加入等體積的酚(注意是酸酚pH4.5):氯仿:異戊醇(25:24:1)抽提(10 000 rpm,4℃,5 min)。

     

    5.  取上清,等體積的氯仿:異戊醇(24:1)抽提(10 000 rpm,4℃,5 min)。

     

    6.  加入1/4V體積10 M LiCl溶液,4℃放置6h以上(或過夜)。

     

    7.  10 000 rpm,4℃離心20 min。


    8.  棄上清,用500 ul SSTE溶解沉淀。

     

    9.  酚:氯仿:異戊醇(25:24:1)抽提兩次,氯仿:異戊醇(24:1)抽提1次(10 000 rpm,4℃,5 min)。

     

    10.  加2V體積的無水乙醇,在-70℃冰箱沉淀30 min以上。

     

    11.  12 000 rpm,4℃離心20 min。

     

    12.  棄上清。沉淀用70%酒精漂洗一次,干燥。

     

    13.  加200 ul的DEPC處理水溶解。

     

    14.  用非變性瓊脂糖凝膠電泳和紫外分光光度計掃描檢測RNA的質量。

    (在抽提過程中,若蛋白質含量或其它的雜質還較多,可以增加抽提次數。)

     

    注意事項


    1.  提取RNA請盡量在低溫下操作,如果條件不容許,在室溫下操作的時間要盡可能的短。


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